More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B2940 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B2940  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 288 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00388333  hitchhiker  0.000000297916 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2391  transcriptional regulator, LysR family  97.22 
 
 		 288 aa  588  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2529  transcriptional regulator, LysR family  95.45 
 
 		 290 aa  571  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2464  LysR family transcriptional regulator  93.01 
 
 		 290 aa  560  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.268812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2267  LysR family transcriptional regulator  91.96 
 
 		 290 aa  548  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.211668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2227  LysR family transcriptional regulator  91.96 
 
 		 290 aa  548  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000599262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2184  LysR family transcriptional regulator  91.96 
 
 		 290 aa  550  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.529425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2435  LysR family transcriptional regulator  91.96 
 
 		 290 aa  548  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0368529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2451  transcriptional regulator, LysR family  91.26 
 
 		 290 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.893513 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2240  LysR family transcriptional regulator  88.15 
 
 		 290 aa  530  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.074644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3060  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000262954  decreased coverage  0.0000000999677 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1907  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  unclonable  0.0000102783 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3192  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.863853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3255  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.841591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1767  transcriptional regulator, LysR family  31.14 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114066  normal  0.776401 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3285  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 297 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0242325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3543  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 297 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3500  transcriptional regulator, LysR family  30.93 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3482  transcriptional regulator, LysR family  31.49 
 
 		 297 aa  162  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3199  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0827152  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3495  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0190038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3511  transcriptional regulator, LysR family  31.42 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0223  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 314 aa  152  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0511  transcriptional regulator, LysR family  29.11 
 
 		 699 aa  148  9e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795049 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0896  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.204372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6329  transcriptional regulator, LysR family  30.88 
 
 		 299 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0290063  hitchhiker  0.00524783 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1747  transcriptional regulator, LysR family  31.96 
 
 		 283 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.337394  normal  0.482419 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0620  transcriptional regulator, LysR family  29.82 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.37658  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1293  LysR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1151  transcriptional regulator, LysR family  30.2 
 
 		 307 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.88835 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1470  transcriptional regulator, LysR family  30.17 
 
 		 291 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3211  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2056  HTH-type transcriptional regulator GltR  30.31 
 
 		 285 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3514  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 283 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3297  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 283 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3557  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 283 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.423553  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3501  transcriptional regulator, LysR family  31.27 
 
 		 283 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3267  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3511  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3522  transcriptional regulator, LysR family  29.31 
 
 		 283 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3213  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.146504  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02471  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.16 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.606343  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1091  transcriptional regulator, LysR family  27.16 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0201845  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2734  LysR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0381749  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02435  hypothetical protein  27.16 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.778712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1100  LysR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00749087  normal  0.244926 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2972  LysR substrate binding domain-containing protein  28.24 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2838  LysR substrate binding domain protein  28.24 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2860  putative LysR substrate binding domain  28.24 
 
 		 314 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.25895 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2856  LysR substrate binding domain protein  28.24 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.294581  normal  0.729486 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3814  transcriptional regulator, LysR family  25.89 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2754  LysR substrate binding domain protein  28.24 
 
 		 299 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2203  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 287 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.460556  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1757  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2864  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0164886  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  28.47 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2730  LysR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.118271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0188  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  28.47 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  28.47 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 297 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  28.47 
 
 		 297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2419  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.37 
 
 		 292 aa  115  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0230  transcriptional regulator, LysR family  28.22 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1657  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.46 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0307226  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0226  LysR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0223  transcriptional regulator, LysR family  28.22 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0195  LysR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  25.8 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8516  transcriptional regulator, LysR family  26.46 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0247  transcriptional regulator, LysR family  28.22 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0804  transcription regulator protein  28.14 
 
 		 302 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.540321 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5097  transcriptional regulator, LysR family  28.22 
 
 		 288 aa  113  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2324  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.3 
 
 		 286 aa  112  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0191  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 288 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 297 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1928  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.46 
 
 		 290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0121617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0205  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1081  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0208  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3436  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0820  transcriptional regulator, LysR family  27.46 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.378943  normal  0.194336 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 314 aa  109  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0334  LysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000502074  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1668  transcriptional regulator, LysR family  29.2 
 
 		 296 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  25.61 
 
 		 296 aa  108  8.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7088  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 314 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2373  transcriptional regulator, LysR family  25.73 
 
 		 300 aa  108  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4044  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 326 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2284  LysR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.471609  hitchhiker  0.00164938 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0750  transcriptional regulator, LysR family  26.78 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.467939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>