More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2464 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_2464  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 290 aa  603  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.268812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2529  transcriptional regulator, LysR family  96.9 
 
 		 290 aa  587  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2451  transcriptional regulator, LysR family  94.48 
 
 		 290 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.893513 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2267  LysR family transcriptional regulator  94.48 
 
 		 290 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.211668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2227  LysR family transcriptional regulator  94.48 
 
 		 290 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000599262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2435  LysR family transcriptional regulator  94.48 
 
 		 290 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0368529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2940  transcriptional regulator, LysR family  93.01 
 
 		 288 aa  560  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00388333  hitchhiker  0.000000297916 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2184  LysR family transcriptional regulator  91.03 
 
 		 290 aa  551  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.529425  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2391  transcriptional regulator, LysR family  92.31 
 
 		 288 aa  553  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2240  LysR family transcriptional regulator  86.36 
 
 		 290 aa  519  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.074644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3192  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.863853  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1767  transcriptional regulator, LysR family  31.62 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114066  normal  0.776401 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3482  transcriptional regulator, LysR family  31.96 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3255  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.841591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3199  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 297 aa  172  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0827152  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3285  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 297 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0242325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3543  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 297 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3500  transcriptional regulator, LysR family  31.06 
 
 		 297 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1907  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  unclonable  0.0000102783 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3060  transcriptional regulator, LysR family  32.52 
 
 		 293 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000262954  decreased coverage  0.0000000999677 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3495  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 297 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0190038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3511  transcriptional regulator, LysR family  31.62 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0511  transcriptional regulator, LysR family  29.15 
 
 		 699 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795049 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0223  transcriptional regulator, LysR family  27.89 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 300 aa  142  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0896  LysR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.204372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6329  transcriptional regulator, LysR family  30.53 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0290063  hitchhiker  0.00524783 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0620  transcriptional regulator, LysR family  27.65 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.37658  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1151  transcriptional regulator, LysR family  29.13 
 
 		 307 aa  135  9e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.88835 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1293  LysR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1747  transcriptional regulator, LysR family  30.61 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.337394  normal  0.482419 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1470  transcriptional regulator, LysR family  29.63 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2056  HTH-type transcriptional regulator GltR  29.86 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3511  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3297  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3267  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3211  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3557  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.423553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3514  transcriptional regulator, LysR family  28.32 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  26.5 
 
 		 316 aa  123  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3501  transcriptional regulator, LysR family  29.9 
 
 		 283 aa  123  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 297 aa  122  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  28.82 
 
 		 297 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  28.82 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3814  transcriptional regulator, LysR family  26.56 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3522  transcriptional regulator, LysR family  27.97 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1757  LysR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  28.82 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02471  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.56 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.606343  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1091  transcriptional regulator, LysR family  26.56 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0201845  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1100  LysR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00749087  normal  0.244926 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  28.82 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02435  hypothetical protein  26.56 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.778712  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2734  LysR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0381749  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2419  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.62 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1657  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.46 
 
 		 290 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0307226  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 314 aa  119  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2860  putative LysR substrate binding domain  27.15 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.25895 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2856  LysR substrate binding domain protein  27.15 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.294581  normal  0.729486 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2754  LysR substrate binding domain protein  27.48 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2838  LysR substrate binding domain protein  27.15 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1928  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.11 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0121617  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2864  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0164886  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0334  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000502074  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2972  LysR substrate binding domain-containing protein  27.15 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0188  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2730  LysR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.118271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  26.62 
 
 		 305 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0687  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 311 aa  116  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3213  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 283 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.146504  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2203  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 287 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.460556  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2324  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.66 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3775  LysR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 292 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3757  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0230  transcriptional regulator, LysR family  28.42 
 
 		 288 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1888  LysR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 306 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 300 aa  112  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5097  transcriptional regulator, LysR family  28.07 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0226  LysR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0195  LysR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0223  transcriptional regulator, LysR family  28.07 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1081  LysR family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0809  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.46 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02086  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.46 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0640427  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0205  LysR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02045  hypothetical protein  27.46 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.074382  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2293  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.46 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3293  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.46 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.020887  normal  0.438576 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1115  transcriptional regulator, LysR family  25.86 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0236  LysR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  0.151625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>