More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0620 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0620  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 304 aa  617  1e-176  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.37658  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6329  transcriptional regulator, LysR family  45.17 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0290063  hitchhiker  0.00524783 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3192  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.863853  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3199  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0827152  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3482  transcriptional regulator, LysR family  38.38 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1907  LysR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 308 aa  192  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  unclonable  0.0000102783 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1767  transcriptional regulator, LysR family  38.05 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114066  normal  0.776401 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3495  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0190038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3500  transcriptional regulator, LysR family  36.15 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3285  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 297 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0242325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3543  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 297 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3255  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 297 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.841591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3511  transcriptional regulator, LysR family  35.14 
 
 		 297 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3060  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 293 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000262954  decreased coverage  0.0000000999677 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0223  transcriptional regulator, LysR family  36.8 
 
 		 314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3814  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869159  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02471  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.9 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.606343  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1091  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0201845  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02435  hypothetical protein  33.9 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.778712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1100  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00749087  normal  0.244926 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2734  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0381749  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0511  transcriptional regulator, LysR family  38.79 
 
 		 699 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795049 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2730  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.118271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2864  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0164886  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0896  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 295 aa  158  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.204372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1151  transcriptional regulator, LysR family  34.41 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2972  LysR substrate binding domain-containing protein  32.53 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2860  putative LysR substrate binding domain  31.37 
 
 		 314 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.25895 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2838  LysR substrate binding domain protein  32.19 
 
 		 299 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2856  LysR substrate binding domain protein  32.19 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.294581  normal  0.729486 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2754  LysR substrate binding domain protein  31.85 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1470  transcriptional regulator, LysR family  30.03 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.91996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2184  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.529425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2529  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2240  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 290 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.074644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2203  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 287 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.460556  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2464  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.268812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2267  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.211668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2227  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000599262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1747  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.337394  normal  0.482419 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2435  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0368529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2451  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.893513 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2940  transcriptional regulator, LysR family  29.82 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00388333  hitchhiker  0.000000297916 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2056  HTH-type transcriptional regulator GltR  28.42 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3501  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0548  transcriptional regulator, LysR family  36.15 
 
 		 272 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3211  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1293  LysR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000772751  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2391  transcriptional regulator, LysR family  29.12 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3511  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 283 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3522  transcriptional regulator, LysR family  29.9 
 
 		 283 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3514  transcriptional regulator, LysR family  28.33 
 
 		 283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3297  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3557  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.423553  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1151  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 307 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.88835 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3267  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.486644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3213  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.146504  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0188  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5097  transcriptional regulator, LysR family  29.97 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0280  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3308  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4716  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 296 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0223  transcriptional regulator, LysR family  29.97 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0226  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0205  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0195  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0208  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5687  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0230  transcriptional regulator, LysR family  29.63 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2180  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000148525  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0191  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0247  transcriptional regulator, LysR family  29.63 
 
 		 288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1081  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.440964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0214  transcription regulator protein  35.6 
 
 		 288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1908  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.605315  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 297 aa  119  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5225  transcriptional regulator, LysR family  32.07 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0804  transcription regulator protein  35 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.540321 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  34.14 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1244  transcriptional regulator, LysR family  31.01 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0149  putative Rubisco transcriptional regulator  30.07 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2660  LysR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1939  transcriptional regulator, LysR family  31.14 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514267  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2361  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 287 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 297 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  30.29 
 
 		 316 aa  115  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4525  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 297 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4554  LysR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0482  transcriptional regulator, LysR family  30.98 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.545808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0468  transcriptional regulator, LysR family  30.98 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4032  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660064  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0706  LysR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.897426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0454  LysR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.499714  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1817  hypothetical protein  34.4 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.504025  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1661  LysR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3677  transcriptional regulator, LysR family  31.9 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1385  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.134108  normal  0.498861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>