More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2086 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2086  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 307 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363313  normal  0.654508 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2323  transcriptional regulator, LysR family  83.06 
 
 		 307 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6329  transcriptional regulator, LysR family  35.13 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0290063  hitchhiker  0.00524783 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  35.69 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0223  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 		 314 aa  122  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2823  transcriptional regulator, LysR family  35.13 
 
 		 305 aa  122  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135524  normal  0.141091 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7088  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5687  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.145424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1312  LysR family transcriptional regulator  35.13 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0843658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0511  transcriptional regulator, LysR family  32.3 
 
 		 699 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795049 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1612  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3737  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 292 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.440992 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2570  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1450  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1151  transcriptional regulator, LysR family  28.23 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3012  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  31.25 
 
 		 289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.450438  hitchhiker  0.000703378 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1907  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  unclonable  0.0000102783 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2472  LysR family substrate binding transcriptional regulator  31.25 
 
 		 289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5919  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0217311  normal  0.163471 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0281  LysR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3577  transcriptional regulator, LysR family  38.74 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0937432  normal  0.112769 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01483  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.69 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2120  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296049  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1608  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0486  LysR substrate-binding  34.02 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3060  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 293 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000262954  decreased coverage  0.0000000999677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8034  transcriptional regulator, LysR family  30.92 
 
 		 300 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01494  hypothetical protein  30.69 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2830  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 303 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2132  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.54811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1646  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1558  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1388  LysR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.275315 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1905  LysR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.204877 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2410  transcriptional regulator, LysR family  30.18 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.975942  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2139  transcriptional regulator, LysR family  30.07 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1668  transcriptional regulator, LysR family  30.07 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3677  transcriptional regulator, LysR family  30.07 
 
 		 292 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1385  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.134108  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0620  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 304 aa  105  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.37658  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0928  LysR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 304 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1410  LysR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 304 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.807333  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4716  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0048  transcriptional regulator, LysR family  30.52 
 
 		 298 aa  105  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.968768  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0214  transcription regulator protein  33.47 
 
 		 288 aa  105  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1638  transcriptional regulator  33.21 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0706  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.897426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0454  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.499714  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0896  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0937961  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1661  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 341 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1817  hypothetical protein  33.21 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.504025  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3926  putative transcriptional regulator  32.01 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3818  LysR family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.173651 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1726  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4227  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0121  transcriptional regulator, LysR family  31.71 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1767  transcriptional regulator, LysR family  30.04 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114066  normal  0.776401 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46170  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0324298 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1424  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18619  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0709  transcriptional regulator OxyR, putative  31.8 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4554  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4525  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3482  transcriptional regulator, LysR family  29.68 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2660  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0896  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.204372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5068  LysR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.728384 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3415  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 386 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1329  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3192  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 295 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.863853  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4032  LysR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660064  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1855  transcriptional regulator, LysR family  29.44 
 
 		 308 aa  102  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0404  LysR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 311 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480543  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1680  transcriptional regulator, LysR family  29.71 
 
 		 293 aa  102  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0476  LysR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 319 aa  102  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3255  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.841591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3199  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0827152  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  25 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3833  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0071  putative transcriptional regulator LysR-type  30.11 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120497  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0665  putative transcriptional regulator OxyR  31.29 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3495  LysR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0190038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3285  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0242325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3500  transcriptional regulator, LysR family  29.33 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  25 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3543  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0745  LysR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1290  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.109093  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  30.15 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3378  transcriptional regulator, LysR family  33.08 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587515  normal  0.118229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3308  LysR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4069  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>