More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2830 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2830  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  597  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3058  LysR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3012  LysR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3027  LysR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  0.0983391 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3378  transcriptional regulator, LysR family  38.89 
 
 		 306 aa  162  8.000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587515  normal  0.118229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3380  transcriptional regulator, LysR family  40.65 
 
 		 299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3737  LysR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 292 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.440992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2077  transcriptional regulator, LysR family  42.57 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3362  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 301 aa  148  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0184586  normal  0.124308 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4879  transcriptional regulator, LysR family  42.45 
 
 		 298 aa  148  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  37.67 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0276  transcriptional regulator, LysR family  36.46 
 
 		 295 aa  145  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265614 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0390  transcriptional regulator, LysR family  42.28 
 
 		 293 aa  145  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1478  LysR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 309 aa  142  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0854082  hitchhiker  0.000187974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5025  transcriptional regulator, LysR family  37.85 
 
 		 295 aa  142  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.860643  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3861  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378583  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3051  transcriptional regulator, LysR family  40.71 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32995  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5293  LysR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382002 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18090  transcriptional regulator, LysR family  41.94 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.502124  normal  0.864979 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  32.42 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  28.41 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  27.65 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1427  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2736  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  29.25 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  34.29 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3308  transcriptional regulator, LysR family  40.25 
 
 		 299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 300 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 300 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  28.03 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  28.03 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 305 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 295 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3939  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0620  LysR, substrate-binding  39.09 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1120  transcriptional regulator, LysR family  36.88 
 
 		 350 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1536  LysR, substrate-binding  41.12 
 
 		 294 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0328  LysR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  32.54 
 
 		 295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4229  putative LysR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 301 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552994  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7065  transcriptional regulator, LysR family  35.77 
 
 		 296 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000862794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1900  LysR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5722  transcriptional regulator, LysR family  35.37 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437697  normal  0.903757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0352  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  35.13 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7050  transcriptional regulator, LysR family  35.1 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5618  transcriptional regulator, LysR family  30.58 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000121214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1618  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4970  transcriptional regulator, LysR family  35.37 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  38.05 
 
 		 290 aa  126  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5919  transcriptional regulator, LysR family  35.37 
 
 		 296 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 293 aa  125  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 307 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5341  transcriptional regulator, LysR family  29.07 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4972  transcriptional regulator, LysR family  35.37 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5335  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6244  transcriptional regulator, LysR family  34.96 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235646  normal  0.352956 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4070  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.409277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5392  transcriptional regulator, LysR family  28.29 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5069  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 294 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2243  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 289 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5454  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 294 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533779  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1279  LysR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 310 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0291  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  32.48 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5012  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 294 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 307 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 308 aa  122  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2850  LysR family substrate binding transcriptional regulator  30.61 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.46504  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2069  LysR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450351  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4914  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1045  transcriptional regulator, LysR family  32 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6562  transcriptional regulator, LysR family  34.96 
 
 		 296 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3660  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4901  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5310  transcriptional regulator, LysR family  28.68 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1453799999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1978  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224272  normal  0.0418865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4044  transcriptional regulator, LysR family  36.08 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.114171 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2282  LysR family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0266423 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3273  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.215219 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0175  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 302 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602241  normal  0.0372511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>