More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3380 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3380  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 299 aa  577  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3378  transcriptional regulator, LysR family  40.27 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587515  normal  0.118229 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0276  transcriptional regulator, LysR family  39.1 
 
 		 295 aa  162  8.000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265614 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4044  transcriptional regulator, LysR family  41.64 
 
 		 307 aa  162  9e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.114171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5293  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 297 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382002 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2830  LysR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0390  transcriptional regulator, LysR family  38.93 
 
 		 293 aa  152  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3737  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 292 aa  149  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.440992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0328  LysR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 299 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 303 aa  145  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3577  transcriptional regulator, LysR family  42.63 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0937432  normal  0.112769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3861  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378583  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  40.5 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1427  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3308  transcriptional regulator, LysR family  38.73 
 
 		 299 aa  134  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0620  LysR, substrate-binding  38.37 
 
 		 307 aa  132  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3362  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0184586  normal  0.124308 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3833  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 301 aa  125  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0709  transcriptional regulator OxyR, putative  33.86 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  37.04 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3027  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  0.0983391 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0665  putative transcriptional regulator OxyR  33.86 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  40.18 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4662  LysR family substrate binding transcriptional regulator  28.46 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2736  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  28.99 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2291  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11333  normal  0.519031 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5025  transcriptional regulator, LysR family  35.5 
 
 		 295 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.860643  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3012  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3058  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1478  LysR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0854082  hitchhiker  0.000187974 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  40.64 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2077  transcriptional regulator, LysR family  43.03 
 
 		 302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  31.18 
 
 		 302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3855  transcriptional regulator, LysR family  34.17 
 
 		 316 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4609  transcriptional regulator, LysR family  35.34 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.461419 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  36.99 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  28.42 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  39 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 300 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2087  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.589785  normal  0.993199 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20370  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.975596 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1389  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5650  transcriptional regulator, LysR family  31.64 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  37.1 
 
 		 316 aa  116  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  28.42 
 
 		 296 aa  115  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4535  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 312 aa  116  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0528  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454001 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1244  transcriptional regulator, LysR family  35.37 
 
 		 286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1536  LysR, substrate-binding  38.33 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  28.79 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2801  transcriptional regulator, substrate-binding, LysR family protein  29.96 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1045  transcriptional regulator, LysR family  35.39 
 
 		 303 aa  113  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1670  LysR substrate-binding protein  36.16 
 
 		 287 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.903503  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 292 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2928  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46680  Transcriptional regulator, LysR-family  35 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4879  transcriptional regulator, LysR family  38.37 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2454  LysR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 321 aa  112  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332878  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 296 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 298 aa  112  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4012  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 298 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23730  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 297 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0194065 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0157  transcriptional regulator, LysR family  37.78 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3211  transcriptional regulator, LysR family  29.82 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3140  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1026  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1650  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4335  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.385889  normal  0.337801 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0139  LysR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1888  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0352  transcriptional regulator, LysR family  38.7 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0953  transcriptional regulator, LysR family  35.1 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1352  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0836  transcriptional regulator, LysR family  32.08 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.192255  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1281  transcriptional regulator, LysR family  35.62 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20663  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0586  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.6 
 
 		 304 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1443  transcriptional regulator, LysR family  34.51 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0746  transcriptional regulator, LysR family  41.2 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2850  LysR family substrate binding transcriptional regulator  29.79 
 
 		 290 aa  109  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.46504  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 310 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1279  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 310 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1599  transcriptional regulator, LysR family  32.95 
 
 		 320 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18090  transcriptional regulator, LysR family  41.7 
 
 		 319 aa  108  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.502124  normal  0.864979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 301 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2276  regulatory protein LysR  36.33 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0300565  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0445  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 295 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4628  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0890971  normal  0.246233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  35.85 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>