More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4879 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4879  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 298 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4229  putative LysR family transcriptional regulator  77.66 
 
 		 301 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552994  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18090  transcriptional regulator, LysR family  71.38 
 
 		 319 aa  375  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.502124  normal  0.864979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1478  LysR family transcriptional regulator  65.31 
 
 		 309 aa  368  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0854082  hitchhiker  0.000187974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1618  LysR family transcriptional regulator  68.73 
 
 		 311 aa  358  6e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1536  LysR, substrate-binding  64.73 
 
 		 294 aa  340  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3051  transcriptional regulator, LysR family  61.81 
 
 		 285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32995  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  51.65 
 
 		 343 aa  246  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5025  transcriptional regulator, LysR family  48.9 
 
 		 295 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.860643  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3012  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3058  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3027  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 296 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  0.0983391 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3362  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0184586  normal  0.124308 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  50.8 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1281  transcriptional regulator, LysR family  43.25 
 
 		 290 aa  203  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20663  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4609  transcriptional regulator, LysR family  43.46 
 
 		 289 aa  189  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.461419 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0276  transcriptional regulator, LysR family  41.75 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265614 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1670  LysR substrate-binding protein  41.67 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.903503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5293  LysR family transcriptional regulator  41.34 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382002 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3737  LysR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.440992 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3378  transcriptional regulator, LysR family  39.36 
 
 		 306 aa  165  6.9999999999999995e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587515  normal  0.118229 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2830  LysR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0352  transcriptional regulator, LysR family  41 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  34.71 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1427  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 305 aa  162  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  38.95 
 
 		 301 aa  162  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3861  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 294 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378583  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 305 aa  155  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  40.38 
 
 		 297 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  35.38 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0328  LysR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280372 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  40.69 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  37.3 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 299 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  29.04 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 300 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 305 aa  151  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  29.56 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  29.04 
 
 		 300 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  40.61 
 
 		 316 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 300 aa  148  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 308 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1120  transcriptional regulator, LysR family  40.58 
 
 		 350 aa  148  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 308 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  36.12 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1279  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  29.2 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.83 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  34.83 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  34.83 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0390  transcriptional regulator, LysR family  40.49 
 
 		 293 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  34.83 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 317 aa  146  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 296 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  37.41 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 296 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2848  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 310 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93078  normal  0.0328698 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2850  LysR family substrate binding transcriptional regulator  29.82 
 
 		 290 aa  142  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.46504  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5705  DNA-binding transcriptional regulator CynR  35.91 
 
 		 295 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.202456 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3308  transcriptional regulator, LysR family  42.98 
 
 		 299 aa  142  8e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1342  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318091  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6115  transcriptional regulator, LysR family  36.29 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 300 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2482  LysR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086853  normal  0.0180215 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5949  DNA-binding transcriptional regulator CynR  36.44 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233312  normal  0.638196 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2282  LysR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0266423 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  35.84 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  29.3 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5225  transcriptional regulator, LysR family  38.67 
 
 		 316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5108  LysR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3234  DNA-binding transcriptional regulator CynR  36.36 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.842433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 301 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3561  LysR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 316 aa  139  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1535  DNA-binding transcriptional regulator CynR  37.8 
 
 		 300 aa  139  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.195582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  34.69 
 
 		 293 aa  138  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0187  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  31.16 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4649  LysR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235656  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>