More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A3211 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A3211  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 
290 aa  597  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2928  LysR family transcriptional regulator  94.48 
 
 
290 aa  563  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3140  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 
295 aa  239  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  39.79 
 
 
288 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1757  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
289 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3423  transcriptional regulator, LysR family  36.84 
 
 
289 aa  193  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000235779 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1735  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
289 aa  192  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
289 aa  191  9e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2000  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
289 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.504431  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1778  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
289 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000761412  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1916  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
289 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0657607  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0412  transcriptional regulator  36.43 
 
 
297 aa  190  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0159161  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19930  transcriptional regulator  33.68 
 
 
294 aa  176  4e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169185  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2462  transcriptional regulator, LysR family  32.29 
 
 
294 aa  175  7e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.341726  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03270  transcriptional regulator  33.22 
 
 
305 aa  171  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2021  transcriptional regulator, LysR family  35.91 
 
 
263 aa  165  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000475915  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1952  transcriptional regulator, LysR family  35.52 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1920  transcriptional regulator, LysR family  35.91 
 
 
263 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.304852  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2935  transcriptional regulator, LysR family  30.66 
 
 
304 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2919  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 
290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226862  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3185  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 
295 aa  145  6e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  0.982451 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0673  LysR family transcriptional regulator  29.64 
 
 
289 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2390  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
299 aa  139  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1864  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
294 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2418  transcriptional regulator  31.1 
 
 
294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0285418 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3373  hypothetical protein  30.57 
 
 
292 aa  136  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  29.43 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 
302 aa  129  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  29.06 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  29.06 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  29.06 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  29.06 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1597  putative transcriptional regulator LysR-type  32.43 
 
 
308 aa  125  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0551  transcriptional regulator, LysR family protein  32.58 
 
 
294 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0807  LysR family transcriptional regulator  29.34 
 
 
297 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
305 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
300 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  28.81 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2817  LysR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  30.45 
 
 
301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 
300 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  27.84 
 
 
300 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2159  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 
303 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5293  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
297 aa  118  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.382002 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4995  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631415  normal  0.721068 
 
 
-
 
NC_004310  BR0029  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0030  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  27.68 
 
 
300 aa  116  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  29.11 
 
 
296 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  29.01 
 
 
309 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1279  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 
310 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  29.01 
 
 
309 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5151  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 
302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.58822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4879  transcriptional regulator, LysR family  30.14 
 
 
298 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2180  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000148525  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  27.52 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  27.91 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3562  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17090  Transcriptional regulator, LysR family  27.33 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
300 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  27.39 
 
 
302 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 
305 aa  113  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 
297 aa  113  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
300 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
290 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
300 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0497  LysR family transcriptional regulator  25.44 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479645  normal  0.474406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1478  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 
309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0854082  hitchhiker  0.000187974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3153  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00364917  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 
305 aa  112  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
300 aa  112  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0831  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
298 aa  112  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3435  LysR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
295 aa  112  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107817  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2830  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
303 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5025  transcriptional regulator, LysR family  30.99 
 
 
295 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.860643  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  26.83 
 
 
300 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2282  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573268  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2581  transcriptional regulator, LysR family  29.37 
 
 
312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4466  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 
316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3090  transcriptional regulator, LysR family  28.12 
 
 
283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0026  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.615193  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4070  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 
297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.409277  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3380  transcriptional regulator, LysR family  29.82 
 
 
299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3514  LysR family transcriptional regulator  28.27 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0347689  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3722  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  30.58 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  26.48 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
307 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1120  transcriptional regulator, LysR family  28.37 
 
 
350 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1345  transcriptional regulator, LysR family  28.17 
 
 
307 aa  110  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1368  LysR family transcriptional regulator  27.47 
 
 
304 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114163 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 
306 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  27.99 
 
 
298 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3861  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378583  normal  0.0796172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>