More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2462 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2462  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 294 aa  602  1.0000000000000001e-171  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19930  transcriptional regulator  52.43 
 
 		 294 aa  337  1.9999999999999998e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03270  transcriptional regulator  52.25 
 
 		 305 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  39.36 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3211  transcriptional regulator, LysR family  32.29 
 
 		 290 aa  175  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2928  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3140  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 295 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0412  transcriptional regulator  29.15 
 
 		 297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0159161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2000  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.504431  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1778  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000761412  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1757  LysR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1916  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0657607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1735  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 289 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3423  transcriptional regulator, LysR family  27.49 
 
 		 289 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235779 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1952  transcriptional regulator, LysR family  27.65 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018508 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2021  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000475915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1920  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 263 aa  116  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.304852  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1277  transcriptional regulator, LysR family  29.89 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2087  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.589785  normal  0.993199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1547  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4466  LysR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3855  transcriptional regulator, LysR family  32.08 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3775  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4062  hypothetical protein  31.8 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.228225  normal  0.120917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 292 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  30.83 
 
 		 309 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  30.83 
 
 		 309 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1859  LysR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 314 aa  108  9.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430795  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3312  transcriptional regulator, LysR family  31.17 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.782402 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 314 aa  106  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 297 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1855  transcriptional regulator, LysR family  31.84 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 297 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  33.47 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1310  ndhF3 operon transcriptional regulator  30.74 
 
 		 323 aa  104  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1982  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.96 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0673  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2919  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1502  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3185  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  0.982451 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0362  LysR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23730  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0194065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 297 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  28.92 
 
 		 319 aa  99  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2172  transcriptional regulator, LysR family  30.25 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.72 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2625  transcriptional regulator  30.47 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.172216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 290 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  26.42 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4012  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1268  putative HTH-type transcriptional regulator YbhD  28.52 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1888  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 306 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 320 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 310 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1554  transcriptional regulator, LysR family  28.37 
 
 		 309 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15921 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  25.31 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  25.31 
 
 		 292 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  25.31 
 
 		 292 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2659  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 313 aa  95.9  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0266  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 313 aa  95.9  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  25.31 
 
 		 292 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2790  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 309 aa  95.9  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.491071  normal  0.0474339 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2090  LysR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 293 aa  95.9  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.115384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2390  LysR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 299 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  28.93 
 
 		 301 aa  95.5  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1883  transcriptional regulator, LysR family  28.03 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0687382  normal  0.7379 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4335  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.385889  normal  0.337801 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2639  transcriptional regulator  31.89 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0807  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0873  transcriptional regulator, LysR family  31.17 
 
 		 325 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.164971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2273  transcriptional regulator LysR family  30.98 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.351493  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0037  transcriptional regulator, LysR family  29.86 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.279269  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0038  transcriptional regulator, LysR family  29.86 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.744574 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26010  Transcriptional regulator, LysR family  29.64 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02614  transcriptional regulator LysR family  29.97 
 
 		 296 aa  93.2  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3757  LysR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 316 aa  93.6  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3373  hypothetical protein  26.02 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1614  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 311 aa  92.8  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.625262  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4412  LysR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 300 aa  92.4  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.481295  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2047  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  28.45 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.595043  normal  0.109117 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2252  transcriptional regulator, LysR family  31.4 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3192  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.863853  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0687  LysR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591422  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3204  transcriptional regulator, LysR family  29.71 
 
 		 326 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0357264  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3255  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.841591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>