More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0412 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0412  transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  610  1e-173  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0159161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2928  LysR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3211  transcriptional regulator, LysR family  36.43 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3140  LysR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  37.08 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19930  transcriptional regulator  29.39 
 
 		 294 aa  149  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2462  transcriptional regulator, LysR family  29.15 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0807  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1778  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000761412  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1916  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0657607  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  29.25 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1735  LysR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 289 aa  132  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2000  LysR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 289 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.504431  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1757  LysR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 289 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3423  transcriptional regulator, LysR family  34.21 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235779 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 289 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1920  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.304852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2021  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000475915  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2390  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1952  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018508 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03270  transcriptional regulator  27.03 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3373  hypothetical protein  28.74 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  28.31 
 
 		 297 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 317 aa  119  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  29.23 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  29.23 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  29.23 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  29.23 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5225  transcriptional regulator, LysR family  26.96 
 
 		 316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 316 aa  116  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 310 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1347  transcriptional regulator, LysR family  29.17 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.98443  normal  0.727871 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 		 292 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  25.35 
 
 		 316 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2418  transcriptional regulator  29.78 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0285418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1120  transcriptional regulator, LysR family  27.73 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1279  LysR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 310 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  27.36 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0498  transcriptional regulator, LysR family  30.82 
 
 		 292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3323  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0711414  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0843  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 293 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3435  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 295 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0970  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0205462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0699  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3153  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00364917  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5255  LysR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0821  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0342019  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  31.85 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0844  transcriptional regulator, LysR family  27.93 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.033432 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0856  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.252777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  31.48 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3185  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  0.982451 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3514  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0347689  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 311 aa  105  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0262  LysR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 294 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5397  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.11 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2919  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 290 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5029  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.534863  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3338  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714315  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4548  LysR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456524 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2851  transcriptional regulator, LysR family  29.64 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5262  LysR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2252  transcriptional regulator, LysR family  31.84 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3562  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5879  LysR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.927972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3233  transcriptional regulator, LysR family  27.85 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00363202 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2159  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4438  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948245 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4958  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 295 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.468232 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2935  transcriptional regulator, LysR family  28.17 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17090  Transcriptional regulator, LysR family  26.28 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  29.06 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 295 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  26.64 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2471  LysR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.643373 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3623  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  29.06 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2077  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3073  LysR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6244  transcriptional regulator, LysR family  29.71 
 
 		 296 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235646  normal  0.352956 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3204  transcriptional regulator, LysR family  28.47 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0357264  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1145  transcriptional regulator CysB-like protein  29.93 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207377  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46680  Transcriptional regulator, LysR-family  29.18 
 
 		 297 aa  99.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2910  transcriptional regulator CysB-like protein  27.96 
 
 		 313 aa  99  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.254391 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2757  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  27.57 
 
 		 326 aa  99  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0538429  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00477  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  29.15 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3053  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.979958  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2547  LysR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 310 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.372947 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2292  transcriptional regulator CysB-like protein  29.07 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.524252  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0551  transcriptional regulator, LysR family protein  25.87 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0266  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4970  transcriptional regulator, LysR family  29.29 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>