More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_19930 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_19930  transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  617  1e-176  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03270  transcriptional regulator  68.6 
 
 		 305 aa  429  1e-119  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2462  transcriptional regulator, LysR family  52.43 
 
 		 294 aa  337  1.9999999999999998e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.341726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  41.64 
 
 		 288 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2928  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3211  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3140  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 295 aa  168  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0412  transcriptional regulator  29.39 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0159161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1757  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2000  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.504431  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1735  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 289 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1778  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000761412  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1916  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0657607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3423  transcriptional regulator, LysR family  29.97 
 
 		 289 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235779 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1952  transcriptional regulator, LysR family  29.55 
 
 		 263 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018508 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2021  transcriptional regulator, LysR family  29.55 
 
 		 263 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000475915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1920  transcriptional regulator, LysR family  29.55 
 
 		 263 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.304852  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1277  transcriptional regulator, LysR family  29.75 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  29.01 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  29.01 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  29.01 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  29.01 
 
 		 292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  29.01 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2390  LysR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2090  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 293 aa  115  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.115384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3373  hypothetical protein  26.42 
 
 		 292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2919  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1547  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3501  LysR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.829127  normal  0.0458146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0673  LysR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3775  LysR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 292 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1864  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3380  transcriptional regulator, LysR family  30.93 
 
 		 299 aa  105  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2418  transcriptional regulator  27.7 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0285418 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1566  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3185  LysR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  0.982451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23730  LysR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0194065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1982  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.72 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3260  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.444883 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  29.55 
 
 		 310 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0528  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 301 aa  102  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1888  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2087  LysR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.589785  normal  0.993199 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2172  transcriptional regulator, LysR family  28.37 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  29.72 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2935  transcriptional regulator, LysR family  27.99 
 
 		 304 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34290  Transcriptional regualtor, LysR family  27.66 
 
 		 294 aa  99  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  27.08 
 
 		 301 aa  99  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0586  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.58 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0807  LysR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  26.48 
 
 		 309 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  26.48 
 
 		 309 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.76 
 
 		 300 aa  97.1  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4591  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 295 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26180  transcriptional regulator  26.21 
 
 		 302 aa  97.1  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2840  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1599  transcriptional regulator, LysR family  27.78 
 
 		 320 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02614  transcriptional regulator LysR family  25 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3312  transcriptional regulator, LysR family  27.66 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.782402 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2847  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 327 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1763  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2385  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 313 aa  94  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24800  transcriptional regulator  27.85 
 
 		 225 aa  94.4  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  25.93 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 323 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 323 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 323 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 307 aa  92.8  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2760  LysR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 302 aa  92.8  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00129755  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2704  Transcriptional regulator  27.95 
 
 		 304 aa  92.8  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 298 aa  92.8  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  30.38 
 
 		 296 aa  92.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  28.9 
 
 		 303 aa  92.8  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1720  transcriptional regulator, LysR family  27.76 
 
 		 294 aa  92  9e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.820276  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5544  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 301 aa  92.4  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.899335 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  35.11 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0664  transcriptional regulator, LysR family  24.79 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001561  transcriptional regulator LysR family  29.02 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3855  transcriptional regulator, LysR family  26.12 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2560  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 		 325 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000128008 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6292  transcriptional regulator, LysR family  26.62 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4846  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2369  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5695  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.89 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  28.87 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1516  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0354  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2329  transcriptional regulator, LysR family  28.27 
 
 		 324 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5439  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5423  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0829573  normal  0.0352079 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4616  LysR family regulatory protein  27.3 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>