More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6292 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6292  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 303 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5821  LysR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 316 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430138  normal  0.815813 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6638  transcriptional regulator, LysR family  36.55 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.863309  normal  0.341434 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6637  transcriptional regulator, LysR family  35.05 
 
 		 301 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.252067 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2441  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 301 aa  169  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96584 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 301 aa  142  9e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5703  transcriptional regulator, LysR family  31.86 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.351778 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2041  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 296 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2182  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 296 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5998  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3014  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 296 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2701  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 317 aa  132  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1898  transcriptional regulator, LysR family  32.46 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113483  normal  0.573852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2808  transcriptional regulator, LysR family  29.82 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4411  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.429795 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2536  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.11 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.941748  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0199  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.493239 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2619  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 297 aa  125  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3779  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 310 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152286 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3285  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.09 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1589  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.53 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.963842  normal  0.282156 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7048  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 320 aa  122  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2704  Transcriptional regulator  28.9 
 
 		 304 aa  122  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4387  LysR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2078  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.76 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.135243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2094  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3435  transcriptional regulator, LysR family  32.09 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0732  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.67 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3662  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.76 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02687  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.69 
 
 		 311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0851  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0876  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.69 
 
 		 311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2986  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.69 
 
 		 311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02648  hypothetical protein  30.69 
 
 		 311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6343  transcriptional regulator, LysR family  30.83 
 
 		 300 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3161  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.69 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3022  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.69 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0752  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.87 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0319733  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5103  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 403 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2988  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.36 
 
 		 311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0261246 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4109  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.36 
 
 		 311 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000450007 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1023  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.17 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0007  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.378538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4972  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 306 aa  113  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.884957  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3860  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 306 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3251  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.83 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000182985 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2536  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 357 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3837  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.2 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0970  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.83 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5993  LysR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.248146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4381  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1436  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4421  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.655491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1384  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.684256  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4432  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0212  transcriptional activator LysR  29.11 
 
 		 311 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5518  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1142  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4395  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.322468  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8014  transcriptional regulator, LysR family  30.67 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0848  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2081  transcriptional regulator, LysR family  27.96 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6146  LysR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.69148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6063  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 304 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3626  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.58 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5699  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 304 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3487  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.22 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6547  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 304 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94219  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1389  LysR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 295 aa  105  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5316  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 337 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0838  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.62 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.101081 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.17 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.0310844 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2788  LysR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4770  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.27 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2919  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6544  transcriptional regulator, LysR family  27.44 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0395202 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.69 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000462598 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2001  LysR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3346  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.69 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0358858 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3821  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.66 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3164  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.69 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000034  transcriptional regulator LysR family protein  28.14 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000511263  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1758  transcriptional regulator, LysR family  27.63 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068602  normal  0.477555 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3230  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.69 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332914 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0050  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5108  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00133603 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1644  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.51 
 
 		 302 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1880  transcription regulator protein  29.39 
 
 		 324 aa  102  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4882  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.92 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5404  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.92 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3484  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.92 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.657517  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3182  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.36 
 
 		 311 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0668  transcriptional regulator, LysR family  30.31 
 
 		 332 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0273303  normal  0.212728 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3726  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.27 
 
 		 315 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161263 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8309  transcriptional regulator LysR family  30 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1819  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.321718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2142  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3140  LysR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7088  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.48 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>