More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0668 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0668  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 332 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0273303  normal  0.212728 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1880  transcription regulator protein  55.24 
 
 		 324 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2808  transcriptional regulator, LysR family  48.09 
 
 		 316 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2536  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  47.77 
 
 		 329 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.941748  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1758  transcriptional regulator, LysR family  53.33 
 
 		 324 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068602  normal  0.477555 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3846  LysR family transcriptional regulator  48.14 
 
 		 343 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2081  transcriptional regulator, LysR family  52.68 
 
 		 324 aa  298  9e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1450  LysR family transcriptional regulator  50.3 
 
 		 349 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308203  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1795  transcriptional regulator, LysR family  50.87 
 
 		 321 aa  277  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130136  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5103  LysR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 403 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5316  LysR family transcriptional regulator  49.69 
 
 		 337 aa  268  7e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2536  LysR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 357 aa  268  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3582  LysR family transcriptional regulator  51.13 
 
 		 356 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.938584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3938  LysR family transcriptional regulator  51.13 
 
 		 337 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0094  LysR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22128 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2704  Transcriptional regulator  31.47 
 
 		 304 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 301 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1589  DNA-binding transcriptional regulator LysR  33.33 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.963842  normal  0.282156 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1436  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 313 aa  129  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5108  transcriptional regulator, LysR family  30.66 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00133603 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5993  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 304 aa  126  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.248146 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8309  transcriptional regulator LysR family  33.57 
 
 		 300 aa  126  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6547  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 304 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94219  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2078  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.66 
 
 		 301 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.135243 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6063  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 304 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3662  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.66 
 
 		 301 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5699  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 304 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0199  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.493239 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4411  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.429795 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2619  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 297 aa  123  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4395  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 301 aa  123  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.322468  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3487  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.91 
 
 		 307 aa  122  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3626  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.91 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3014  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 296 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2182  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2041  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2435  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4421  LysR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.655491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7088  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.01 
 
 		 309 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7048  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1838  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.69135 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1819  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 309 aa  117  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.321718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0752  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.89 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0319733  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5998  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 304 aa  116  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5518  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0571  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8014  transcriptional regulator, LysR family  27.86 
 
 		 300 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5454  transcriptional regulator, LysR family  33.61 
 
 		 305 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.803003  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3779  LysR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 310 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152286 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2701  LysR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 317 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3821  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.24 
 
 		 301 aa  112  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4460  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031991 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2142  LysR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90528  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0212  transcriptional activator LysR  28.42 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2111  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4381  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1898  transcriptional regulator, LysR family  34.96 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113483  normal  0.573852 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4882  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.67 
 
 		 304 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5404  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.67 
 
 		 304 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3484  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.67 
 
 		 304 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.657517  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3860  LysR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3837  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.51 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2760  transcriptional regulator, LysR family  31.42 
 
 		 321 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.436538 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4167  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6544  transcriptional regulator, LysR family  27.24 
 
 		 305 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0395202 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2357  transcriptional regulator, LysR family  31.42 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0418601  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0050  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3726  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.33 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161263 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0496  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2988  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.18 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0261246 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0838  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29 
 
 		 304 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.101081 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4343  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 301 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4972  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.884957  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0732  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.85 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02687  DNA-binding transcriptional dual regulator  28.87 
 
 		 311 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2986  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.87 
 
 		 311 aa  106  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0876  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.87 
 
 		 311 aa  106  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02648  hypothetical protein  28.87 
 
 		 311 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3022  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.52 
 
 		 311 aa  106  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2497  transcription regulator protein  29.1 
 
 		 321 aa  106  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.82783  normal  0.625013 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3285  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.07 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0851  transcriptional regulator, LysR family  28.42 
 
 		 311 aa  105  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3161  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.18 
 
 		 311 aa  105  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4770  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.67 
 
 		 304 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2590  LysR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67170  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.161893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4109  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.84 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000450007 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2342  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2877  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0715401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2197  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.567497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8322  transcriptional regulator LysR family  31.38 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489992  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0394  LysR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780233  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4453  LysR family transcriptional regulator  28 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  hitchhiker  0.0000436239 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2001  LysR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1544  transcriptional regulator, LysR family  32.39 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5821  LysR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430138  normal  0.815813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0067  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.45 
 
 		 304 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.0310844 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0354  LysR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 310 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>