More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0394 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0394  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 286 aa  578  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780233  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5108  transcriptional regulator, LysR family  50.91 
 
 		 300 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00133603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4236  transcriptional regulator, LysR family  37.41 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2619  LysR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0050  LysR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4432  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2704  Transcriptional regulator  35.4 
 
 		 304 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0199  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.493239 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6063  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 304 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5699  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 304 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6547  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 304 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94219  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5993  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 304 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.248146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6343  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7396  Transcriptional regulator  35.17 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.709918  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4387  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 292 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 301 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5518  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1838  LysR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.69135 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4993  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0133249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8014  transcriptional regulator, LysR family  34.3 
 
 		 300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1898  transcriptional regulator, LysR family  34.32 
 
 		 322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113483  normal  0.573852 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4347  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 302 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5998  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4411  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.429795 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2701  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4445  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 296 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.400594 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7048  LysR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3487  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.93 
 
 		 307 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3014  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4369  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.536466  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2435  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0752  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.07 
 
 		 306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0319733  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8309  transcriptional regulator LysR family  34.44 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1439  transcriptional regulator, LysR family  34.48 
 
 		 301 aa  119  7.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5454  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.803003  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3346  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.48 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0358858 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2182  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0732  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.55 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3435  transcriptional regulator, LysR family  31.92 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3164  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.48 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2041  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.48 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000462598 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3230  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.48 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2111  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1384  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.684256  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7088  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.17 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3285  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.15 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3821  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.8 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3779  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152286 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3182  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.74 
 
 		 311 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1436  LysR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3837  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.32 
 
 		 307 aa  115  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4348  LysR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 308 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3626  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.56 
 
 		 306 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0851  transcriptional regulator, LysR family  31.9 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2988  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.47 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0261246 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4381  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5703  transcriptional regulator, LysR family  29.44 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.351778 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2620  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0513234  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02687  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.47 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6120  LysR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 313 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.387063 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3161  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.47 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02648  hypothetical protein  31.47 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0876  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.47 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2142  LysR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 296 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2986  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.47 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0212  transcriptional activator LysR  29.14 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3022  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.03 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4395  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.322468  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4343  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8322  transcriptional regulator LysR family  31.23 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489992  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0119  transcriptional regulator, LysR family  26.79 
 
 		 316 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4109  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.03 
 
 		 311 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000450007 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3251  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.78 
 
 		 313 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000182985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0970  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.78 
 
 		 313 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4770  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.6 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.6 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.0310844 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4882  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.88 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0007  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.378538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5404  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.88 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4752  LysR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3484  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.88 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.657517  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4460  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031991 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0014  transcriptional regulator, LysR family  35.09 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.12063  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1644  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.33 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1023  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.78 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3726  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.08 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161263 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2001  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0699  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 317 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0791561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0838  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.17 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.101081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3860  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2069  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 309 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.156662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6146  LysR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.69148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4421  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 304 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.655491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0014  transcriptional regulator, LysR family  33.77 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0668  transcriptional regulator, LysR family  30.57 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0273303  normal  0.212728 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4408  LysR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 344 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.830984  normal  0.0872893 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3464  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 309 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.26806  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18480  transcriptional regulator  28.62 
 
 		 309 aa  102  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3109  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 309 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.129161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>