More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3014 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3014  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
296 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2182  LysR family transcriptional regulator  95.61 
 
 
296 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2041  LysR family transcriptional regulator  95.61 
 
 
296 aa  567  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1436  LysR family transcriptional regulator  45.33 
 
 
313 aa  247  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2111  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
298 aa  231  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2142  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
296 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90528  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2704  Transcriptional regulator  38.19 
 
 
304 aa  198  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2590  LysR family transcriptional regulator  37.87 
 
 
338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0699  LysR family transcriptional regulator  41.7 
 
 
317 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0791561  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0496  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 
315 aa  189  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2847  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  0.325567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6120  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
313 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.387063 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2760  transcriptional regulator, LysR family  37.16 
 
 
321 aa  178  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.436538 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2197  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
312 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.567497  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2699  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 
296 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.133782  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2357  transcriptional regulator, LysR family  37.16 
 
 
321 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0418601  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2788  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
292 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4395  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 
301 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.322468  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2342  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
312 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3821  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.15 
 
 
301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3487  DNA-binding transcriptional regulator LysR  35.59 
 
 
307 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2619  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
297 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2497  transcription regulator protein  36.02 
 
 
321 aa  169  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.82783  normal  0.625013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5825  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 
305 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0224  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 
309 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2094  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
329 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67170  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 
318 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.161893  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4972  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
306 aa  169  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.884957  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3256  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
292 aa  168  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.14149  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3860  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
306 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
301 aa  167  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3464  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 
309 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.26806  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1898  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 
322 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113483  normal  0.573852 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0851  transcriptional regulator, LysR family  35.96 
 
 
311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0752  DNA-binding transcriptional regulator LysR  33.56 
 
 
306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0319733  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4343  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3022  DNA-binding transcriptional regulator LysR  35.62 
 
 
311 aa  166  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2988  DNA-binding transcriptional regulator LysR  35.27 
 
 
311 aa  166  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0261246 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3161  DNA-binding transcriptional regulator LysR  35.62 
 
 
311 aa  166  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02687  DNA-binding transcriptional dual regulator  35.62 
 
 
311 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1935  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
307 aa  166  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0876  DNA-binding transcriptional regulator LysR  35.62 
 
 
311 aa  166  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02648  hypothetical protein  35.62 
 
 
311 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2986  DNA-binding transcriptional regulator LysR  35.62 
 
 
311 aa  166  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0947  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2210  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1932  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1671  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0307  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1235  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0848  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 
302 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228944  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4109  DNA-binding transcriptional regulator LysR  35.27 
 
 
311 aa  165  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000450007 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2069  LysR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
309 aa  165  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.156662 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0217  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5998  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0354  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3109  LysR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.129161 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3285  DNA-binding transcriptional regulator LysR  36.01 
 
 
307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0732  DNA-binding transcriptional regulator LysR  35.71 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5993  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 
304 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.248146 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6063  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
304 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3626  DNA-binding transcriptional regulator LysR  35.22 
 
 
306 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5699  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
304 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1544  transcriptional regulator, LysR family  35.77 
 
 
300 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4442  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
334 aa  162  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal  0.600336 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4707  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 
294 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6547  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 
304 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94219  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3837  DNA-binding transcriptional regulator LysR  35.05 
 
 
307 aa  159  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2701  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
317 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4411  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
303 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.429795 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1023  DNA-binding transcriptional regulator LysR  33.33 
 
 
313 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4203  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 
306 aa  156  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4445  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 
296 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.400594 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0970  DNA-binding transcriptional regulator LysR  33.33 
 
 
313 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3251  DNA-binding transcriptional regulator LysR  33.33 
 
 
313 aa  156  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000182985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3713  transcriptional regulator, LysR family  37.13 
 
 
295 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0343753 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0212  transcriptional activator LysR  33.45 
 
 
311 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1998  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
299 aa  155  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5703  transcriptional regulator, LysR family  31.71 
 
 
295 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.351778 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0199  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
297 aa  155  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.493239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5291  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 
303 aa  155  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7088  DNA-binding transcriptional regulator LysR  33.33 
 
 
309 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4348  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
308 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4381  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
303 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4421  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
304 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.655491  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4752  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
305 aa  153  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222249  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4387  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
292 aa  152  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4460  LysR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031991 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4369  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
304 aa  152  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.536466  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0119  transcriptional regulator, LysR family  30.56 
 
 
316 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2435  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
306 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4993  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
303 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0133249  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7048  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
320 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1644  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.33 
 
 
302 aa  149  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4770  DNA-binding transcriptional regulator LysR  34.15 
 
 
304 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  34.15 
 
 
304 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.0310844 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3726  DNA-binding transcriptional regulator LysR  33.8 
 
 
315 aa  149  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.161263 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  34.27 
 
 
311 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000462598 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3346  DNA-binding transcriptional regulator LysR  34.27 
 
 
311 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0358858 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3164  DNA-binding transcriptional regulator LysR  34.27 
 
 
311 aa  148  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>