More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2182 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2182  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2041  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3014  LysR family transcriptional regulator  95.61 
 
 		 296 aa  567  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1436  LysR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 313 aa  242  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2111  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 298 aa  229  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2142  LysR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 296 aa  225  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2704  Transcriptional regulator  37.85 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2590  LysR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 338 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0699  LysR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0791561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0496  LysR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 315 aa  185  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6120  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 313 aa  179  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.387063 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2847  LysR family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 317 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  0.325567 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2788  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 292 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2342  LysR family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 312 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2699  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.133782  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2760  transcriptional regulator, LysR family  34.8 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.436538 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2197  LysR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.567497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2094  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2357  transcriptional regulator, LysR family  34.8 
 
 		 321 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0418601  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4395  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.322468  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3464  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 309 aa  169  8e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.26806  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5825  LysR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 305 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4972  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 306 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.884957  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3860  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67170  LysR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.161893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2069  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.156662 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2619  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1935  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 307 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3109  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.129161 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3821  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.47 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0851  transcriptional regulator, LysR family  35.69 
 
 		 311 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3256  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 292 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.14149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0224  LysR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 309 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2497  transcription regulator protein  34.52 
 
 		 321 aa  165  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.82783  normal  0.625013 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3022  DNA-binding transcriptional regulator LysR  34.95 
 
 		 311 aa  165  9e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02687  DNA-binding transcriptional dual regulator  35.34 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3161  DNA-binding transcriptional regulator LysR  34.95 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2986  DNA-binding transcriptional regulator LysR  35.34 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3487  DNA-binding transcriptional regulator LysR  34.24 
 
 		 307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0876  DNA-binding transcriptional regulator LysR  35.34 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02648  hypothetical protein  35.34 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2988  DNA-binding transcriptional regulator LysR  34.6 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0261246 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0848  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0752  DNA-binding transcriptional regulator LysR  33.9 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0319733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4109  DNA-binding transcriptional regulator LysR  34.6 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000450007 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5998  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3285  DNA-binding transcriptional regulator LysR  35.93 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1898  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 322 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113483  normal  0.573852 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0947  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1932  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1235  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1671  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2210  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0732  DNA-binding transcriptional regulator LysR  34.02 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0307  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4343  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0217  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4442  LysR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 334 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal  0.600336 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0354  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3626  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.99 
 
 		 306 aa  159  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4421  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.655491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7088  DNA-binding transcriptional regulator LysR  34.8 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4707  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 294 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4411  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.429795 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4445  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.400594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1544  transcriptional regulator, LysR family  34.75 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3713  transcriptional regulator, LysR family  36.76 
 
 		 295 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0343753 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5993  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.248146 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3837  DNA-binding transcriptional regulator LysR  34.01 
 
 		 307 aa  155  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6063  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 304 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2701  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 317 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5699  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 304 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5291  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 303 aa  155  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1023  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.62 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5703  transcriptional regulator, LysR family  31.71 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.351778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0212  transcriptional activator LysR  32.65 
 
 		 311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6547  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94219  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2435  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3251  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.62 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000182985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0970  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.62 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4348  LysR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 308 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4752  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0199  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.493239 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4381  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 303 aa  152  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4203  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 306 aa  152  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1998  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0119  transcriptional regulator, LysR family  30.21 
 
 		 316 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3164  DNA-binding transcriptional regulator LysR  34.48 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3346  DNA-binding transcriptional regulator LysR  34.48 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0358858 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  34.48 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000462598 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3230  DNA-binding transcriptional regulator LysR  34.48 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332914 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7048  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3182  DNA-binding transcriptional regulator LysR  34.14 
 
 		 311 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4460  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 308 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031991 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4369  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 304 aa  149  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.536466  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0571  LysR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 298 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1644  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.78 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4770  DNA-binding transcriptional regulator LysR  35.15 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  35.29 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.0310844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>