More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4752 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4752  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 305 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0119  transcriptional regulator, LysR family  80.47 
 
 		 316 aa  496  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6120  LysR family transcriptional regulator  64.04 
 
 		 313 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.387063 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4203  LysR family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 306 aa  328  9e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2111  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2142  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1436  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1998  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2041  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 296 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2182  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 296 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3014  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 296 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0496  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2094  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2760  transcriptional regulator, LysR family  30.88 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.436538 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0699  LysR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0791561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2357  transcriptional regulator, LysR family  30.88 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0418601  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1935  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 307 aa  136  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2197  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.567497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4236  transcriptional regulator, LysR family  27.99 
 
 		 306 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2497  transcription regulator protein  30 
 
 		 321 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.82783  normal  0.625013 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3779  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152286 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2590  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2847  LysR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  0.325567 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3726  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.08 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2342  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3860  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5404  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.84 
 
 		 304 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4882  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.84 
 
 		 304 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3484  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.84 
 
 		 304 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.657517  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2619  LysR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1544  transcriptional regulator, LysR family  30.28 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0838  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.49 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.101081 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0050  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7088  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.1 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4770  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.15 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.39 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.0310844 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3464  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 309 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.26806  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0199  LysR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.493239 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0067  LysR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3109  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 309 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.129161 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0732  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.61 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4993  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0133249  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2078  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.96 
 
 		 301 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.135243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3662  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.96 
 
 		 301 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1589  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.96 
 
 		 311 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.963842  normal  0.282156 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000677  LysR-family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.708378  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0752  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.61 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0319733  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2069  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.156662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5825  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5108  transcriptional regulator, LysR family  28.33 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00133603 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7048  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 320 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0212  transcriptional activator LysR  29.32 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2546  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715041  normal  0.706169 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3626  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.68 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1898  transcriptional regulator, LysR family  26.77 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113483  normal  0.573852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67170  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.161893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3487  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.54 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5993  LysR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.248146 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6063  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5699  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2699  LysR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 296 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.133782  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0007  LysR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 325 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.378538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6547  LysR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 304 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94219  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1142  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5998  LysR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2001  LysR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1644  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.25 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0394  LysR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780233  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2701  LysR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4445  LysR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.400594 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2988  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.56 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0261246 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4343  LysR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 301 aa  108  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5703  transcriptional regulator, LysR family  27.08 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.351778 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0851  transcriptional regulator, LysR family  25.94 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3256  LysR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.14149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4972  LysR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.884957  normal  0.156049 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02687  DNA-binding transcriptional dual regulator  25.56 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2986  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.56 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4109  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.56 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000450007 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02648  hypothetical protein  25.56 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0876  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.56 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4411  LysR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.429795 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3022  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.19 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3995  transcriptional regulator, LysR family  27.05 
 
 		 302 aa  106  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3821  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  25.68 
 
 		 301 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5821  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 316 aa  105  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430138  normal  0.815813 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3161  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.19 
 
 		 311 aa  105  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4395  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 301 aa  105  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.322468  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4207  LysR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2788  LysR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5291  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6967  transcriptional regulator, LysR family  26.37 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4167  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06556  transcriptional regulator  26.06 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3285  DNA-binding transcriptional regulator LysR  24.52 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0224  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02614  transcriptional regulator LysR family  27.3 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3230  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.67 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332914 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3346  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.67 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0358858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>