More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3995 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3995  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 302 aa  608  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0133  transcriptional regulator, LysR family  87.42 
 
 		 302 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4115  transcriptional regulator, LysR family  76.49 
 
 		 302 aa  481  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214102  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4404  transcriptional regulator, LysR family  75.42 
 
 		 302 aa  474  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000677  LysR-family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.708378  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06556  transcriptional regulator  36.19 
 
 		 282 aa  166  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67170  LysR family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.161893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5291  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5825  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2699  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 296 aa  159  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.133782  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2788  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 292 aa  159  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2497  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.82783  normal  0.625013 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4442  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 334 aa  152  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal  0.600336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2760  transcriptional regulator, LysR family  34.55 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.436538 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2357  transcriptional regulator, LysR family  34.55 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0418601  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0699  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0791561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1544  transcriptional regulator, LysR family  36.68 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1998  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3256  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.14149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2041  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2590  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2182  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3014  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 296 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1935  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 307 aa  142  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1436  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0067  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2197  LysR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.567497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2847  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  0.325567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2342  LysR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0224  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2111  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3713  transcriptional regulator, LysR family  32.41 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0343753 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2142  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4707  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3464  LysR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.26806  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3109  LysR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.129161 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2069  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.156662 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2190  LysR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3779  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 310 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152286 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0947  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1235  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0217  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1932  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2210  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0307  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 310 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2078  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.25 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.135243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3662  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.25 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1671  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 310 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6120  LysR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 313 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.387063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1589  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.91 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.963842  normal  0.282156 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0014  transcriptional regulator, LysR family  26.12 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.12063  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4203  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0441  LysR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4411  LysR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.429795 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0496  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2546  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715041  normal  0.706169 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0752  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.23 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0319733  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3860  LysR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4752  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 305 aa  106  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0014  transcriptional regulator, LysR family  25.68 
 
 		 298 aa  105  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4183  LysR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 312 aa  105  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465046 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3182  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.74 
 
 		 311 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3346  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.74 
 
 		 311 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0358858 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3164  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.74 
 
 		 311 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0732  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.1 
 
 		 309 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7088  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.7 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3230  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.74 
 
 		 311 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.74 
 
 		 311 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000462598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0119  transcriptional regulator, LysR family  24.25 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 301 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1439  transcriptional regulator, LysR family  29.01 
 
 		 301 aa  102  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2988  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.89 
 
 		 311 aa  102  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0261246 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1023  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.76 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2001  LysR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3285  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.39 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3022  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.89 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4993  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0133249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3726  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.69 
 
 		 315 aa  99.8  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161263 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3251  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.4 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000182985 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3626  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.67 
 
 		 306 aa  99.8  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0970  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.4 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0838  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.43 
 
 		 304 aa  99.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.101081 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3161  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.56 
 
 		 311 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3487  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.25 
 
 		 307 aa  99.4  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5454  transcriptional regulator, LysR family  26.47 
 
 		 305 aa  99.4  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.803003  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02687  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.56 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0851  transcriptional regulator, LysR family  26.56 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2986  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.56 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0876  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.56 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02648  hypothetical protein  26.56 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4109  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.23 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000450007 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0571  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4207  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5404  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.43 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3484  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.43 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.657517  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4882  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.43 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4770  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.09 
 
 		 304 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4445  LysR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.400594 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.09 
 
 		 304 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.0310844 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2620  transcriptional regulator, LysR family  26.36 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0513234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>