More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3230 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3230  DNA-binding transcriptional regulator LysR  100 
 
 		 311 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  100 
 
 		 311 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000462598 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3346  DNA-binding transcriptional regulator LysR  100 
 
 		 311 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0358858 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3164  DNA-binding transcriptional regulator LysR  100 
 
 		 311 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3182  DNA-binding transcriptional regulator LysR  99.36 
 
 		 311 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02687  DNA-binding transcriptional dual regulator  87.14 
 
 		 311 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0851  transcriptional regulator, LysR family  86.82 
 
 		 311 aa  545  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02648  hypothetical protein  87.14 
 
 		 311 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2986  DNA-binding transcriptional regulator LysR  87.14 
 
 		 311 aa  546  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3161  DNA-binding transcriptional regulator LysR  86.82 
 
 		 311 aa  545  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0876  DNA-binding transcriptional regulator LysR  87.14 
 
 		 311 aa  546  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4109  DNA-binding transcriptional regulator LysR  86.5 
 
 		 311 aa  544  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000450007 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3022  DNA-binding transcriptional regulator LysR  86.82 
 
 		 311 aa  546  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2988  DNA-binding transcriptional regulator LysR  86.17 
 
 		 311 aa  541  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0261246 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3285  DNA-binding transcriptional regulator LysR  84.64 
 
 		 307 aa  514  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3837  DNA-binding transcriptional regulator LysR  76.29 
 
 		 307 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3251  DNA-binding transcriptional regulator LysR  70.74 
 
 		 313 aa  454  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000182985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0970  DNA-binding transcriptional regulator LysR  70.74 
 
 		 313 aa  454  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1023  DNA-binding transcriptional regulator LysR  70.74 
 
 		 313 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3487  DNA-binding transcriptional regulator LysR  73.44 
 
 		 307 aa  451  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3626  DNA-binding transcriptional regulator LysR  72.61 
 
 		 306 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0732  DNA-binding transcriptional regulator LysR  75.52 
 
 		 309 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0752  DNA-binding transcriptional regulator LysR  75.17 
 
 		 306 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0319733  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0212  transcriptional activator LysR  63.14 
 
 		 311 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2078  DNA-binding transcriptional regulator LysR  53.36 
 
 		 301 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.135243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3662  DNA-binding transcriptional regulator LysR  53.36 
 
 		 301 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1589  DNA-binding transcriptional regulator LysR  55.48 
 
 		 311 aa  305  7e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.963842  normal  0.282156 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7088  DNA-binding transcriptional regulator LysR  52.54 
 
 		 309 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2001  LysR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0838  DNA-binding transcriptional regulator LysR  51 
 
 		 304 aa  289  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.101081 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4770  DNA-binding transcriptional regulator LysR  51 
 
 		 304 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  51 
 
 		 304 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.0310844 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3726  DNA-binding transcriptional regulator LysR  49.35 
 
 		 315 aa  286  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161263 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5404  DNA-binding transcriptional regulator LysR  50.67 
 
 		 304 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4882  DNA-binding transcriptional regulator LysR  50.67 
 
 		 304 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3484  DNA-binding transcriptional regulator LysR  50.67 
 
 		 304 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.657517  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3779  LysR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 310 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152286 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1819  LysR family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.321718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1644  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  47.39 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4411  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 303 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.429795 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7048  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 320 aa  205  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2701  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 317 aa  205  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1838  LysR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.69135 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1898  transcriptional regulator, LysR family  37.72 
 
 		 322 aa  201  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113483  normal  0.573852 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4387  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 292 aa  195  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0199  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.493239 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5998  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4381  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 303 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6544  transcriptional regulator, LysR family  37.81 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0395202 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2704  Transcriptional regulator  36.71 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0050  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 310 aa  178  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4369  LysR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 304 aa  176  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.536466  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6063  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 304 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5699  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 304 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4348  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 308 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5993  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 304 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.248146 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4460  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 308 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031991 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6547  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94219  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6343  transcriptional regulator, LysR family  35.34 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2435  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0848  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0007  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 325 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.378538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5454  transcriptional regulator, LysR family  35.42 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.803003  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2619  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1384  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 309 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.684256  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4236  transcriptional regulator, LysR family  34.81 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2182  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2041  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8014  transcriptional regulator, LysR family  34.8 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4408  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 344 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.830984  normal  0.0872893 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3014  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 296 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5108  transcriptional regulator, LysR family  32.52 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00133603 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3634  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 304 aa  152  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.246418 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4432  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 323 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6967  transcriptional regulator, LysR family  31.63 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000034  transcriptional regulator LysR family protein  29.7 
 
 		 304 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000511263  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7396  Transcriptional regulator  32.97 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.709918  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4395  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 301 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.322468  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5703  transcriptional regulator, LysR family  32.23 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.351778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6146  LysR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.69148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5518  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4167  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4993  LysR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0133249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1142  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2590  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 338 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3435  transcriptional regulator, LysR family  29.73 
 
 		 296 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8322  transcriptional regulator LysR family  31.73 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489992  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3821  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.92 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2620  transcriptional regulator, LysR family  32.26 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0513234  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0699  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0791561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4445  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.400594 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0014  transcriptional regulator, LysR family  29.79 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.12063  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0014  transcriptional regulator, LysR family  29.05 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8309  transcriptional regulator LysR family  29.23 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4343  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2142  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4421  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.655491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1998  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 299 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0394  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 286 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780233  normal  0.51441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>