More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3109 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3464  LysR family transcriptional regulator  99.68 
 
 		 309 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.26806  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3109  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.129161 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2069  LysR family transcriptional regulator  95.79 
 
 		 309 aa  588  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.156662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2094  LysR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 329 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2041  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2182  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3014  LysR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1898  transcriptional regulator, LysR family  34.23 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113483  normal  0.573852 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3860  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2701  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4203  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 306 aa  152  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5998  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7048  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6063  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5699  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6547  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94219  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5993  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 304 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.248146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2111  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4442  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 334 aa  138  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal  0.600336 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0050  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3256  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.14149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6120  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.387063 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0354  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 310 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4408  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 344 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.830984  normal  0.0872893 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000034  transcriptional regulator LysR family protein  30.95 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000511263  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4616  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 289 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2142  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0119  transcriptional regulator, LysR family  30.8 
 
 		 316 aa  132  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0848  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4411  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.429795 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2590  LysR family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2704  Transcriptional regulator  29.82 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2546  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715041  normal  0.706169 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2619  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2788  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 292 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3821  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.67 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000677  LysR-family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 293 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.708378  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4167  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0199  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.493239 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4421  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.655491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0838  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.64 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.101081 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3779  LysR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 310 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152286 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5108  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00133603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4395  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.322468  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4882  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.94 
 
 		 304 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4752  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 305 aa  122  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5404  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.94 
 
 		 304 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3484  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.94 
 
 		 304 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.657517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1544  transcriptional regulator, LysR family  32.26 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1407  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 344 aa  122  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4387  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0699  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0791561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4343  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3995  transcriptional regulator, LysR family  29.72 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0067  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 301 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4770  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.94 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3726  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.25 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1838  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.69135 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1935  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.94 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.0310844 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2497  transcription regulator protein  31.58 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.82783  normal  0.625013 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4707  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8014  transcriptional regulator, LysR family  32.16 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4993  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0133249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7088  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.9 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7396  Transcriptional regulator  30.51 
 
 		 297 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.709918  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5703  transcriptional regulator, LysR family  28.77 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.351778 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0007  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.378538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0133  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2760  transcriptional regulator, LysR family  31.18 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.436538 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0496  LysR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4972  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.884957  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2699  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.133782  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4236  transcriptional regulator, LysR family  28.96 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2357  transcriptional regulator, LysR family  31.18 
 
 		 321 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0418601  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1998  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6146  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.69148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3634  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.246418 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0307  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1671  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1436  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4432  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3285  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.07 
 
 		 307 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1235  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 310 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2210  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 310 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1932  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 310 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0947  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 310 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5518  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0217  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 310 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0224  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 309 aa  113  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3487  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.68 
 
 		 307 aa  112  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2988  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.82 
 
 		 311 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0261246 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3626  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.68 
 
 		 306 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3837  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.21 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2197  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.567497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6343  transcriptional regulator, LysR family  32.14 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1384  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.684256  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2847  LysR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  0.325567 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4348  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.286195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>