More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4183 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4183  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 312 aa  621  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465046 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0441  LysR family transcriptional regulator  62.58 
 
 		 306 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4207  LysR family transcriptional regulator  62.46 
 
 		 302 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1544  transcriptional regulator, LysR family  35.49 
 
 		 300 aa  155  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67170  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.161893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5825  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3256  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 292 aa  149  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.14149  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2699  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 296 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.133782  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1998  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5291  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1935  LysR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 307 aa  143  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2788  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4442  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal  0.600336 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0699  LysR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 317 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0791561  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2497  transcription regulator protein  33.56 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.82783  normal  0.625013 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2041  LysR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2182  LysR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2760  transcriptional regulator, LysR family  31.12 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.436538 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2357  transcriptional regulator, LysR family  31.93 
 
 		 321 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0418601  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3014  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1671  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0067  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1932  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0307  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2210  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1235  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0947  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0217  LysR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4707  LysR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2590  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0224  LysR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2142  LysR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3713  transcriptional regulator, LysR family  30.88 
 
 		 295 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0343753 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4972  LysR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.884957  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000677  LysR-family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 293 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.708378  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1436  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 313 aa  115  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4203  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 306 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2111  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 298 aa  109  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 301 aa  108  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2197  LysR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.567497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3995  transcriptional regulator, LysR family  27.97 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2342  LysR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2190  LysR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2847  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 317 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  0.325567 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06556  transcriptional regulator  29.93 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0571  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6120  LysR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 313 aa  99.4  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.387063 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4752  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 305 aa  99  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4115  transcriptional regulator, LysR family  28.63 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0119  transcriptional regulator, LysR family  27.38 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2704  Transcriptional regulator  26.98 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4404  transcriptional regulator, LysR family  27.84 
 
 		 302 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4421  LysR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 304 aa  95.9  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.655491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8014  transcriptional regulator, LysR family  30.48 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5998  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2435  LysR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4387  LysR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 292 aa  92.8  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2619  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 297 aa  92.4  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5993  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.248146 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0496  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 315 aa  89.4  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1644  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.9 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3109  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.129161 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3464  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 309 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.26806  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7048  LysR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7088  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.68 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4348  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 308 aa  87  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0133  transcriptional regulator, LysR family  27.17 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1898  transcriptional regulator, LysR family  26.07 
 
 		 322 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113483  normal  0.573852 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4395  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 301 aa  86.3  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.322468  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2069  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 309 aa  85.5  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.156662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5518  LysR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5703  transcriptional regulator, LysR family  28.29 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.351778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4993  LysR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0133249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2701  LysR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2808  transcriptional regulator, LysR family  25.55 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4460  LysR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031991 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8309  transcriptional regulator LysR family  30.8 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2536  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  25.29 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.941748  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1384  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.684256  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3487  DNA-binding transcriptional regulator LysR  24.56 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6547  LysR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94219  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0212  transcriptional activator LysR  24.38 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2546  LysR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715041  normal  0.706169 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5699  LysR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6063  LysR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4347  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4411  LysR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.429795 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0354  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1142  LysR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3821  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  24.6 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1407  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833584 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4453  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  hitchhiker  0.0000436239 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2441  LysR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96584 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0848  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  23.95 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0532  transcriptional regulator, LysR family  28.32 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.27 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.0310844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>