More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1407 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1407  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 344 aa  710    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833584 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0354  LysR family transcriptional regulator  64.86 
 
 		 310 aa  419  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000034  transcriptional regulator LysR family protein  34.56 
 
 		 304 aa  192  9e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000511263  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2704  Transcriptional regulator  34.03 
 
 		 304 aa  170  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0148  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0716986  decreased coverage  0.0000000188935 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0199  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 297 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.493239 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5993  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 304 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.248146 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5703  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 295 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.351778 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4369  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.536466  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6063  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 304 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5699  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 304 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6547  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 304 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94219  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0848  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2619  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 297 aa  142  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1838  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.69135 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5108  transcriptional regulator, LysR family  31.56 
 
 		 300 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00133603 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4432  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 323 aa  139  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8309  transcriptional regulator LysR family  31.79 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0050  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 310 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4411  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.429795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5518  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 300 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3014  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 296 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2142  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 296 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4167  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3821  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.66 
 
 		 301 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2988  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.4 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0261246 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4343  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 301 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1898  transcriptional regulator, LysR family  28.48 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113483  normal  0.573852 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2546  LysR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715041  normal  0.706169 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2041  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2182  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0212  transcriptional activator LysR  30.5 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1023  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.1 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3022  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.72 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3251  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.1 
 
 		 313 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000182985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0970  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.1 
 
 		 313 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3161  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.72 
 
 		 311 aa  129  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4109  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.72 
 
 		 311 aa  129  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000450007 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4236  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 306 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02687  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.72 
 
 		 311 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0876  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.72 
 
 		 311 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02648  hypothetical protein  30.72 
 
 		 311 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3487  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.41 
 
 		 307 aa  129  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2986  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.72 
 
 		 311 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0851  transcriptional regulator, LysR family  30.38 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8014  transcriptional regulator, LysR family  29.86 
 
 		 300 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2808  transcriptional regulator, LysR family  28.78 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6146  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.69148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7088  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.69 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3109  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.129161 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3464  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 309 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.26806  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4395  LysR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.322468  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4972  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.884957  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1436  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 313 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2701  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 317 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3626  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.38 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2197  LysR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 312 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.567497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7048  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 320 aa  123  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2342  LysR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2094  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 329 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2069  LysR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.156662 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2536  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.37 
 
 		 329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.941748  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2435  LysR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2111  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1142  LysR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 302 aa  119  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4348  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 308 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6544  transcriptional regulator, LysR family  28.47 
 
 		 305 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0395202 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0732  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.97 
 
 		 309 aa  119  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4460  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 308 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031991 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3837  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.12 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1384  LysR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.684256  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3285  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.47 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3860  LysR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0752  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.78 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0319733  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2847  LysR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  0.325567 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5821  LysR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430138  normal  0.815813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5291  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5998  LysR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 304 aa  116  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0496  LysR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0094  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 326 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1450  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 349 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308203  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4882  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.54 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0838  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.29 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.101081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5404  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.54 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3484  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.54 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.657517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2590  LysR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4445  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.400594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4381  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2788  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 292 aa  109  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5454  transcriptional regulator, LysR family  27.54 
 
 		 305 aa  109  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.803003  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6343  transcriptional regulator, LysR family  28.68 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3634  LysR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.246418 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.84 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.0310844 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2078  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.39 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.135243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3779  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152286 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4770  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.84 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2001  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3662  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.39 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1589  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.93 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.963842  normal  0.282156 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>