More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0148 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0148  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  639    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0716986  decreased coverage  0.0000000188935 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000034  transcriptional regulator LysR family protein  32.19 
 
 		 304 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000511263  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0354  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5993  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.248146 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0848  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6547  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94219  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6063  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5699  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1407  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 344 aa  146  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833584 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2619  LysR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7048  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 320 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5998  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 304 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3014  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 296 aa  132  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1142  LysR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 302 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4972  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 306 aa  132  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.884957  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2704  Transcriptional regulator  28.33 
 
 		 304 aa  129  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0050  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 310 aa  129  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4411  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.429795 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0199  LysR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.493239 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2701  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4432  LysR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 323 aa  123  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2182  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 296 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2041  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 296 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5703  transcriptional regulator, LysR family  25.77 
 
 		 295 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.351778 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1898  transcriptional regulator, LysR family  27.84 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113483  normal  0.573852 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6638  transcriptional regulator, LysR family  27.21 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.863309  normal  0.341434 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3435  transcriptional regulator, LysR family  31.14 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2988  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.19 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0261246 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3161  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.53 
 
 		 311 aa  113  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3022  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.53 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4109  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.53 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000450007 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02687  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.55 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02648  hypothetical protein  26.55 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2986  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.55 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0876  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.55 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4395  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.322468  normal  0.503505 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0851  transcriptional regulator, LysR family  26.55 
 
 		 311 aa  112  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2094  LysR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 329 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6146  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.69148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7396  Transcriptional regulator  29.37 
 
 		 297 aa  112  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.709918  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3285  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.23 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5518  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2441  LysR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96584 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4343  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 301 aa  109  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8014  transcriptional regulator, LysR family  28.78 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7088  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.04 
 
 		 309 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6343  transcriptional regulator, LysR family  29.7 
 
 		 300 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3487  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.35 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4381  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.53 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.0310844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4770  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.53 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3634  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.246418 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4882  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.18 
 
 		 304 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1345  transcriptional regulator, LysR family  29.92 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5404  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.18 
 
 		 304 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3484  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.18 
 
 		 304 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.657517  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0838  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.83 
 
 		 304 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.101081 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3821  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.28 
 
 		 301 aa  105  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4442  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal  0.600336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3779  LysR family transcriptional regulator  25.72 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152286 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1023  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.08 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3251  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.08 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000182985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0970  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.08 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4387  LysR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3726  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.94 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161263 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4348  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 308 aa  102  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3626  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.35 
 
 		 306 aa  102  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8322  transcriptional regulator LysR family  26.3 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489992  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5024  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0432035  normal  0.889367 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1384  LysR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.684256  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0394  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780233  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0752  DNA-binding transcriptional regulator LysR  24.23 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0319733  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6544  transcriptional regulator, LysR family  24.65 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0395202 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0699  LysR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0791561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3837  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.17 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0067  LysR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 301 aa  99.4  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5108  transcriptional regulator, LysR family  26.91 
 
 		 300 aa  99.4  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00133603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5821  LysR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 316 aa  99  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430138  normal  0.815813 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0732  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.17 
 
 		 309 aa  98.2  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1544  transcriptional regulator, LysR family  27.7 
 
 		 300 aa  97.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2620  transcriptional regulator, LysR family  27.9 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0513234  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0007  LysR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.378538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2435  LysR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8309  transcriptional regulator LysR family  24.22 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2142  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 296 aa  96.3  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2546  LysR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 298 aa  96.3  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715041  normal  0.706169 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2788  LysR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 292 aa  96.3  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2699  LysR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 296 aa  95.9  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.133782  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4993  LysR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 303 aa  95.9  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0133249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1838  LysR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 318 aa  95.9  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.69135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4167  LysR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2001  LysR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1998  LysR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4464  LysR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276318 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3230  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.52 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332914 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3109  LysR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.129161 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1935  LysR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.52 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000462598 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3346  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.52 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0358858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>