More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6146 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6146  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 302 aa  593  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.69148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3435  transcriptional regulator, LysR family  70.07 
 
 		 296 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7048  LysR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 320 aa  205  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1898  transcriptional regulator, LysR family  41.84 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113483  normal  0.573852 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2701  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 317 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5998  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 304 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4411  LysR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.429795 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6343  transcriptional regulator, LysR family  39.85 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4387  LysR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 292 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4432  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 323 aa  169  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5454  transcriptional regulator, LysR family  36.88 
 
 		 305 aa  168  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.803003  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6547  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 304 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94219  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5993  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.248146 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1644  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.23 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6063  LysR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7088  DNA-binding transcriptional regulator LysR  33.45 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5699  LysR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0199  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.493239 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0050  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3487  DNA-binding transcriptional regulator LysR  33.68 
 
 		 307 aa  159  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2619  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1142  LysR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 302 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3626  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.98 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0212  transcriptional activator LysR  32.61 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0007  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 325 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.378538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0970  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.79 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3251  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.79 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000182985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1023  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.79 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0838  DNA-binding transcriptional regulator LysR  33 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.101081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4236  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4770  DNA-binding transcriptional regulator LysR  33 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  33 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.0310844 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3837  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.53 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2704  Transcriptional regulator  32.2 
 
 		 304 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4395  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 301 aa  149  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.322468  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3726  DNA-binding transcriptional regulator LysR  33.56 
 
 		 315 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161263 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3285  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.32 
 
 		 307 aa  146  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02687  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.45 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0876  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.45 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2986  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.45 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4381  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02648  hypothetical protein  30.45 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0851  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 311 aa  145  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3182  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.74 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4343  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5404  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.33 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4882  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.33 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3484  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.33 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.657517  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3022  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.6 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5108  transcriptional regulator, LysR family  32.36 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00133603 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.74 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000462598 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3230  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.74 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332914 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3346  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.74 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0358858 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3164  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.74 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0354  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0848  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 302 aa  142  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3161  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.25 
 
 		 311 aa  142  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3821  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.76 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4109  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.89 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000450007 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0732  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.99 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2988  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.89 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0261246 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0752  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.74 
 
 		 306 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0319733  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4408  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 344 aa  139  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.830984  normal  0.0872893 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4460  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031991 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1838  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.69135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2435  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2142  LysR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000034  transcriptional regulator LysR family protein  32.16 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000511263  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2078  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.26 
 
 		 301 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.135243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3662  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.26 
 
 		 301 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8014  transcriptional regulator, LysR family  31.29 
 
 		 300 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2001  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1589  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.06 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.963842  normal  0.282156 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3014  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2094  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2041  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2182  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4348  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 308 aa  128  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1384  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.684256  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6638  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.863309  normal  0.341434 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4369  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.536466  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3860  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5518  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 300 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1407  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 344 aa  126  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833584 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4453  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 307 aa  126  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  hitchhiker  0.0000436239 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5703  transcriptional regulator, LysR family  30.48 
 
 		 295 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.351778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4464  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276318 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2546  LysR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 298 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715041  normal  0.706169 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0699  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 317 aa  122  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0791561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4421  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.655491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1436  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3779  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 310 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152286 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2441  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 301 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96584 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7396  Transcriptional regulator  28.27 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.709918  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2069  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.156662 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2590  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 338 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4972  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.884957  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3109  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.129161 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5821  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 316 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430138  normal  0.815813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>