More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1436 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1436  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 313 aa  640    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2142  LysR family transcriptional regulator  64.36 
 
 		 296 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0496  LysR family transcriptional regulator  46.82 
 
 		 315 aa  295  5e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3014  LysR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 296 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2182  LysR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 296 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2041  LysR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 296 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2342  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 312 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2197  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.567497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2847  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  0.325567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2111  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 298 aa  216  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6120  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.387063 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4203  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0119  transcriptional regulator, LysR family  31.93 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4752  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222249  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2699  LysR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.133782  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0699  LysR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 317 aa  162  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0791561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2590  LysR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 338 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2760  transcriptional regulator, LysR family  35.92 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.436538 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2357  transcriptional regulator, LysR family  35.92 
 
 		 321 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0418601  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1935  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2497  transcription regulator protein  35.1 
 
 		 321 aa  152  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.82783  normal  0.625013 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4972  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.884957  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1998  LysR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 299 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5998  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2788  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 292 aa  149  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4421  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.655491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3713  transcriptional regulator, LysR family  34.9 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0343753 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2704  Transcriptional regulator  32.83 
 
 		 304 aa  145  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4395  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.322468  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6063  LysR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 304 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5699  LysR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 304 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1544  transcriptional regulator, LysR family  34.83 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5291  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 303 aa  142  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0199  LysR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.493239 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6547  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94219  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3256  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.14149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2701  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3995  transcriptional regulator, LysR family  31.54 
 
 		 302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3860  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0224  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4442  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 334 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal  0.600336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67170  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.161893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5825  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 305 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7048  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2619  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0354  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4707  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1898  transcriptional regulator, LysR family  30.18 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113483  normal  0.573852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3779  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 310 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2094  LysR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5993  LysR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.248146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4381  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0571  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0067  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2435  LysR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4343  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8014  transcriptional regulator, LysR family  31.46 
 
 		 300 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3487  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.69 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0212  transcriptional activator LysR  31.09 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5518  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2546  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715041  normal  0.706169 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5703  transcriptional regulator, LysR family  30.38 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.351778 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3821  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.95 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4411  LysR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.429795 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0947  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1932  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2210  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1235  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4993  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 303 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0133249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5821  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 316 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430138  normal  0.815813 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1671  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 310 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0668  transcriptional regulator, LysR family  32.66 
 
 		 332 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0273303  normal  0.212728 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0307  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 310 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3726  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.33 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161263 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0217  LysR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4445  LysR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 296 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.400594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1589  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.32 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.963842  normal  0.282156 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2078  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.69 
 
 		 301 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.135243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3662  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.69 
 
 		 301 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3626  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.29 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.84 
 
 		 304 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.0310844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4770  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.84 
 
 		 304 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0838  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.33 
 
 		 304 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.101081 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3837  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.62 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4348  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1384  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.684256  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0848  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 302 aa  123  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7088  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.76 
 
 		 309 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0133  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 302 aa  122  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4464  LysR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 301 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1838  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.69135 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4432  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2808  transcriptional regulator, LysR family  31.92 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2536  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.44 
 
 		 329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.941748  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4460  LysR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031991 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3435  transcriptional regulator, LysR family  34.1 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4207  LysR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4387  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4167  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>