More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5825 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5825  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 305 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67170  LysR family transcriptional regulator  96.67 
 
 		 318 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.161893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5291  LysR family transcriptional regulator  72.05 
 
 		 303 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2190  LysR family transcriptional regulator  44.11 
 
 		 297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4442  LysR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 334 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal  0.600336 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0699  LysR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 317 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0791561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2590  LysR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2788  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 292 aa  186  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3713  transcriptional regulator, LysR family  38.83 
 
 		 295 aa  185  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0343753 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0224  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0307  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1235  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1932  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0947  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1671  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2210  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2760  transcriptional regulator, LysR family  39.12 
 
 		 321 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.436538 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0217  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 310 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4707  LysR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 294 aa  178  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2357  transcriptional regulator, LysR family  39.12 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0418601  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2497  transcription regulator protein  38.78 
 
 		 321 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.82783  normal  0.625013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1544  transcriptional regulator, LysR family  40.88 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2699  LysR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.133782  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1998  LysR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 299 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3014  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0067  LysR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3256  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 292 aa  169  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.14149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2041  LysR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 296 aa  168  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2182  LysR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 296 aa  168  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1935  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 307 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3995  transcriptional regulator, LysR family  39.13 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000677  LysR-family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.708378  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4207  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4183  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465046 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0441  LysR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4404  transcriptional regulator, LysR family  36.46 
 
 		 302 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4115  transcriptional regulator, LysR family  34.54 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214102  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0133  transcriptional regulator, LysR family  35.5 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06556  transcriptional regulator  39.1 
 
 		 282 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2142  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 296 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1436  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2111  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4453  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  hitchhiker  0.0000436239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2094  LysR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 329 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6120  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 313 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.387063 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3860  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0119  transcriptional regulator, LysR family  30.04 
 
 		 316 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2342  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4972  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.884957  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3662  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.43 
 
 		 301 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2078  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.43 
 
 		 301 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.135243 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4203  LysR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1589  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.37 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.963842  normal  0.282156 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2546  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715041  normal  0.706169 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2619  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2001  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4752  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2197  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.567497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6547  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 304 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94219  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6063  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 304 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5699  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 304 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4381  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 303 aa  116  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4460  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031991 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7088  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.86 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2536  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.83 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.941748  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4167  LysR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3285  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.84 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3726  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.34 
 
 		 315 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161263 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2808  transcriptional regulator, LysR family  31.49 
 
 		 316 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3821  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.42 
 
 		 301 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5993  LysR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 304 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.248146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4395  LysR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.322468  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2704  Transcriptional regulator  28.51 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0212  transcriptional activator LysR  31.72 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0496  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4343  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1142  LysR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0199  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.493239 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0851  transcriptional regulator, LysR family  31.73 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02687  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.73 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0876  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.73 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2986  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.73 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3022  DNA-binding transcriptional regulator LysR  33.33 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02648  hypothetical protein  31.73 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5998  LysR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 304 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3161  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.37 
 
 		 311 aa  105  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2847  LysR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 317 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  0.325567 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7048  LysR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4770  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.46 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3487  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.63 
 
 		 307 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1795  transcriptional regulator, LysR family  30.17 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130136  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4109  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.62 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000450007 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5821  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430138  normal  0.815813 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0571  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0838  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.23 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.101081 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2988  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.37 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0261246 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.6 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.0310844 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4445  LysR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.400594 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0668  transcriptional regulator, LysR family  32.23 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0273303  normal  0.212728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>