More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0571 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0571  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 298 aa  589  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4421  LysR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 304 aa  275  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.655491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0199  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 297 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.493239 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4343  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4395  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.322468  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3821  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.62 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3014  LysR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1838  LysR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 318 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.69135 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2182  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2041  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4369  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 304 aa  168  9e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.536466  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2704  Transcriptional regulator  33.57 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 301 aa  162  6e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2435  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7088  DNA-binding transcriptional regulator LysR  35.23 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8309  transcriptional regulator LysR family  38.46 
 
 		 300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1384  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 309 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.684256  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2619  LysR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4411  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.429795 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5998  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5993  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.248146 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2142  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2701  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1436  LysR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0014  transcriptional regulator, LysR family  32.32 
 
 		 298 aa  149  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2001  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4348  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3726  DNA-binding transcriptional regulator LysR  34.93 
 
 		 315 aa  149  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161263 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7048  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 320 aa  148  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6547  LysR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94219  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  34.47 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.0310844 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6063  LysR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1898  transcriptional regulator, LysR family  33.1 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113483  normal  0.573852 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5699  LysR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1589  DNA-binding transcriptional regulator LysR  36.3 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.963842  normal  0.282156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4381  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2988  DNA-binding transcriptional regulator LysR  35.96 
 
 		 311 aa  146  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0261246 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4770  DNA-binding transcriptional regulator LysR  34.25 
 
 		 304 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0838  DNA-binding transcriptional regulator LysR  33.9 
 
 		 304 aa  145  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.101081 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0014  transcriptional regulator, LysR family  32.43 
 
 		 298 aa  145  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.12063  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0752  DNA-binding transcriptional regulator LysR  33.56 
 
 		 306 aa  145  8.000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0319733  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2078  DNA-binding transcriptional regulator LysR  35.99 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.135243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3662  DNA-binding transcriptional regulator LysR  35.99 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0851  transcriptional regulator, LysR family  35.99 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4460  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031991 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2536  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.05 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.941748  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3161  DNA-binding transcriptional regulator LysR  35.62 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5404  DNA-binding transcriptional regulator LysR  33.56 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1439  transcriptional regulator, LysR family  35.27 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3022  DNA-binding transcriptional regulator LysR  35.62 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4882  DNA-binding transcriptional regulator LysR  33.56 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3484  DNA-binding transcriptional regulator LysR  33.56 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.657517  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02687  DNA-binding transcriptional dual regulator  35.64 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3779  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 310 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152286 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0876  DNA-binding transcriptional regulator LysR  35.64 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4109  DNA-binding transcriptional regulator LysR  35.27 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000450007 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02648  hypothetical protein  35.64 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2986  DNA-binding transcriptional regulator LysR  35.64 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0212  transcriptional activator LysR  36.36 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3285  DNA-binding transcriptional regulator LysR  33.33 
 
 		 307 aa  142  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0732  DNA-binding transcriptional regulator LysR  33.45 
 
 		 309 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3487  DNA-binding transcriptional regulator LysR  35.14 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5518  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6967  transcriptional regulator, LysR family  32.38 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2620  transcriptional regulator, LysR family  35.92 
 
 		 299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0513234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2808  transcriptional regulator, LysR family  35.27 
 
 		 316 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5703  transcriptional regulator, LysR family  31.33 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.351778 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3837  DNA-binding transcriptional regulator LysR  33.45 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5316  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 337 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2197  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 312 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.567497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3626  DNA-binding transcriptional regulator LysR  35.12 
 
 		 306 aa  135  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2536  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1644  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.33 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3634  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 304 aa  132  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.246418 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2847  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 317 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  0.325567 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2546  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 298 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715041  normal  0.706169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2342  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 312 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2111  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 298 aa  132  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3230  DNA-binding transcriptional regulator LysR  34.23 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332914 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  34.23 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000462598 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3346  DNA-binding transcriptional regulator LysR  34.23 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0358858 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4972  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.884957  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3164  DNA-binding transcriptional regulator LysR  34.23 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5821  LysR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430138  normal  0.815813 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5103  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 403 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0050  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3182  DNA-binding transcriptional regulator LysR  33.89 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0354  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4432  LysR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2760  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.436538 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4167  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6343  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8014  transcriptional regulator, LysR family  30.21 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4387  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 292 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4993  LysR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 303 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0133249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0668  transcriptional regulator, LysR family  31.94 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0273303  normal  0.212728 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3938  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1998  LysR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2357  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0418601  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3582  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.938584  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>