More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2620 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2620  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 299 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0513234  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1439  transcriptional regulator, LysR family  66.78 
 
 		 301 aa  419  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0014  transcriptional regulator, LysR family  58.54 
 
 		 298 aa  343  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.12063  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0014  transcriptional regulator, LysR family  57.68 
 
 		 298 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1838  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 318 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.69135 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3821  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.99 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4395  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.322468  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4343  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0199  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.493239 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2704  Transcriptional regulator  31.72 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4369  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.536466  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0848  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 302 aa  149  8e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8309  transcriptional regulator LysR family  34.81 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5108  transcriptional regulator, LysR family  32.71 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00133603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1023  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.27 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3251  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.93 
 
 		 313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000182985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0970  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.93 
 
 		 313 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2619  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 297 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2988  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.45 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0261246 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3487  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.9 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3022  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.45 
 
 		 311 aa  136  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4421  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.655491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3161  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.45 
 
 		 311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02687  DNA-binding transcriptional dual regulator  29.93 
 
 		 311 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2986  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.93 
 
 		 311 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02648  hypothetical protein  29.93 
 
 		 311 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0876  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.93 
 
 		 311 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0851  transcriptional regulator, LysR family  29.58 
 
 		 311 aa  135  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4109  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.11 
 
 		 311 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000450007 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0752  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.05 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0319733  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0732  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.45 
 
 		 309 aa  133  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3626  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.51 
 
 		 306 aa  133  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4993  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 303 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0133249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0571  LysR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3230  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.26 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3164  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.26 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.26 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000462598 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3346  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.26 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0358858 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3182  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.85 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6343  transcriptional regulator, LysR family  31.39 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3285  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.23 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4167  LysR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 300 aa  125  9e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4411  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.429795 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5998  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 304 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3837  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.52 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4381  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6544  transcriptional regulator, LysR family  28.25 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0395202 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4453  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 307 aa  122  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  hitchhiker  0.0000436239 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1898  transcriptional regulator, LysR family  28.33 
 
 		 322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113483  normal  0.573852 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3014  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0067  LysR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2701  LysR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 317 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3779  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 310 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0212  transcriptional activator LysR  28.47 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6967  transcriptional regulator, LysR family  28 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2041  LysR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2182  LysR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1998  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 299 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1935  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 307 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0394  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780233  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0007  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 325 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.378538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5993  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.248146 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1544  transcriptional regulator, LysR family  31.64 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4387  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 292 aa  112  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2094  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 329 aa  112  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7396  Transcriptional regulator  28.01 
 
 		 297 aa  112  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.709918  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6063  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4348  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6547  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94219  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7048  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1142  LysR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5699  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3713  transcriptional regulator, LysR family  26.62 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0343753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2078  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.34 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.135243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3662  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.34 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1589  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.34 
 
 		 311 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.963842  normal  0.282156 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7088  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.72 
 
 		 309 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0050  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 310 aa  108  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6146  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.69148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3846  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6638  transcriptional regulator, LysR family  30.22 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.863309  normal  0.341434 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2536  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 357 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4445  LysR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.400594 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2497  transcription regulator protein  29.35 
 
 		 321 aa  105  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.82783  normal  0.625013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2435  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 306 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3726  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.67 
 
 		 315 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161263 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5103  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 403 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2357  transcriptional regulator, LysR family  29.55 
 
 		 321 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0418601  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0699  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0791561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1407  LysR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833584 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5454  transcriptional regulator, LysR family  26.28 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.803003  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2546  LysR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715041  normal  0.706169 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2760  transcriptional regulator, LysR family  29.22 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.436538 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2197  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 312 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.567497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8322  transcriptional regulator LysR family  30.68 
 
 		 296 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489992  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1384  LysR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.684256  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4770  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.36 
 
 		 304 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2342  LysR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2111  LysR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>