More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0014 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0014  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 298 aa  607  9.999999999999999e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.12063  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0014  transcriptional regulator, LysR family  95.97 
 
 		 298 aa  586  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2620  transcriptional regulator, LysR family  58.54 
 
 		 299 aa  343  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0513234  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1439  transcriptional regulator, LysR family  57.39 
 
 		 301 aa  338  7e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4343  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4395  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.322468  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3821  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.89 
 
 		 301 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0199  LysR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.493239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1838  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 318 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.69135 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4369  LysR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.536466  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5108  transcriptional regulator, LysR family  31.32 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00133603 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2704  Transcriptional regulator  31.29 
 
 		 304 aa  142  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6343  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 300 aa  142  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8309  transcriptional regulator LysR family  33.69 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4421  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.655491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5998  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2988  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.77 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0261246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2701  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 317 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7048  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 320 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3022  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.77 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0851  transcriptional regulator, LysR family  31.44 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3161  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.77 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0571  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 298 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02687  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.1 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02648  hypothetical protein  31.1 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0876  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.1 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4109  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.43 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000450007 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2986  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.1 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1898  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113483  normal  0.573852 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2619  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0732  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.1 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1023  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.59 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3251  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.59 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000182985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0970  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.59 
 
 		 313 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3487  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.69 
 
 		 307 aa  125  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3285  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.25 
 
 		 307 aa  125  9e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3346  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.79 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0358858 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3230  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.79 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3164  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.79 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.79 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000462598 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3182  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.45 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4411  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 303 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.429795 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3014  LysR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 296 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3837  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.66 
 
 		 307 aa  122  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1998  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1935  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4387  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0752  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.01 
 
 		 306 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0319733  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2041  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2182  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3626  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.81 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0212  transcriptional activator LysR  28.77 
 
 		 311 aa  118  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5699  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 304 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6063  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 304 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6547  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94219  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0848  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0228944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4453  LysR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  hitchhiker  0.0000436239 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4993  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0133249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1644  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.27 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4167  LysR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6638  transcriptional regulator, LysR family  27.85 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.863309  normal  0.341434 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5993  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.248146 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3995  transcriptional regulator, LysR family  26.12 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0394  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780233  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4381  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0007  LysR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 325 aa  109  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.378538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7088  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.85 
 
 		 309 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1142  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2441  LysR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96584 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7396  Transcriptional regulator  28.72 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.709918  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5103  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 403 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1407  LysR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 344 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833584 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0838  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.55 
 
 		 304 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.101081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1544  transcriptional regulator, LysR family  29.19 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6146  LysR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 302 aa  105  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.69148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0699  LysR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 317 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0791561  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2078  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.06 
 
 		 301 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.135243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3662  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.06 
 
 		 301 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2001  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 308 aa  105  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3779  LysR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152286 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0050  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0067  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2536  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 357 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6544  transcriptional regulator, LysR family  25.52 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0395202 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3726  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.14 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161263 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5316  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1450  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 349 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308203  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1589  DNA-binding transcriptional regulator LysR  24.07 
 
 		 311 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.963842  normal  0.282156 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4770  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.58 
 
 		 304 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.58 
 
 		 304 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.0310844 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1436  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 313 aa  102  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5404  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.85 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4404  transcriptional regulator, LysR family  25.68 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2094  LysR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 329 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4882  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.85 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5821  LysR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430138  normal  0.815813 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3484  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.85 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.657517  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4115  transcriptional regulator, LysR family  25.34 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214102  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4203  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>