More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5291 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5291  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  594  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5825  LysR family transcriptional regulator  72.05 
 
 		 305 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67170  LysR family transcriptional regulator  71.72 
 
 		 318 aa  424  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.161893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2190  LysR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2788  LysR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 292 aa  203  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2590  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2760  transcriptional regulator, LysR family  38.87 
 
 		 321 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.436538 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2357  transcriptional regulator, LysR family  38.87 
 
 		 321 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0418601  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2497  transcription regulator protein  38.87 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.82783  normal  0.625013 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4707  LysR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 294 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3256  LysR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 292 aa  185  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.14149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0699  LysR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 317 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0791561  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2699  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 296 aa  182  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.133782  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3713  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0343753 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4442  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 334 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal  0.600336 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0224  LysR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1544  transcriptional regulator, LysR family  39.64 
 
 		 300 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0307  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0947  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1932  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2210  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1235  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1671  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1998  LysR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 299 aa  170  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0217  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3995  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4115  transcriptional regulator, LysR family  35.02 
 
 		 302 aa  162  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214102  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0067  LysR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 301 aa  162  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4404  transcriptional regulator, LysR family  34.68 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1935  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2182  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 296 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2041  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 296 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3014  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 296 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000677  LysR-family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 293 aa  152  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.708378  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0133  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06556  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2142  LysR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 296 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0441  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4183  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465046 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1436  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2111  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4207  LysR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4395  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.322468  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2342  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 312 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3285  DNA-binding transcriptional regulator LysR  35.19 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2197  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.567497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4972  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 306 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.884957  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4453  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  hitchhiker  0.0000436239 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3821  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.02 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3022  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.04 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02687  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.04 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3161  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.72 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02648  hypothetical protein  32.04 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0876  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.04 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2986  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.04 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0851  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2988  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.34 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0261246 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4343  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4109  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.61 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000450007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6120  LysR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.387063 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4167  LysR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 300 aa  119  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0212  transcriptional activator LysR  32.31 
 
 		 311 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2078  DNA-binding transcriptional regulator LysR  33.33 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.135243 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6063  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6547  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94219  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3662  DNA-binding transcriptional regulator LysR  33.33 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5699  LysR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1589  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.74 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.963842  normal  0.282156 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2704  Transcriptional regulator  29.18 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3182  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.31 
 
 		 311 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3860  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 306 aa  116  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1407  LysR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 344 aa  115  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833584 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0496  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 315 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3230  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.31 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332914 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3346  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.31 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0358858 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.31 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000462598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2094  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 329 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3164  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.31 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3487  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.35 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2536  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.73 
 
 		 329 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.941748  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5993  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.248146 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2001  LysR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0732  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.71 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3837  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.68 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1142  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7396  Transcriptional regulator  28.62 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.709918  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4381  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5821  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430138  normal  0.815813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2808  transcriptional regulator, LysR family  29.76 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0752  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.72 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0319733  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4203  LysR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7088  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.72 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0119  transcriptional regulator, LysR family  27.52 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4411  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.429795 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0199  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.493239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3779  LysR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1384  LysR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.684256  normal  0.634474 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5703  transcriptional regulator, LysR family  28.3 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.351778 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0970  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.14 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>