More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4347 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4347  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 302 aa  612  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5108  transcriptional regulator, LysR family  30.53 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00133603 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0838  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.84 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.101081 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3726  DNA-binding transcriptional regulator LysR  33.58 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161263 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5404  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.47 
 
 		 304 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4882  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.47 
 
 		 304 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0199  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.493239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3484  DNA-binding transcriptional regulator LysR  32.47 
 
 		 304 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.657517  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8322  transcriptional regulator LysR family  29.07 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489992  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4411  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 303 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.429795 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0394  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 286 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780233  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4770  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.37 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  31.37 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.0310844 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1898  transcriptional regulator, LysR family  33.84 
 
 		 322 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113483  normal  0.573852 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2704  Transcriptional regulator  31.3 
 
 		 304 aa  126  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5998  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4395  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 301 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.322468  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1644  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2701  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 317 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.992427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7396  Transcriptional regulator  33.19 
 
 		 297 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.709918  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7088  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.1 
 
 		 309 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1589  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.39 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.963842  normal  0.282156 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4432  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2619  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2001  LysR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2078  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.42 
 
 		 301 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.135243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3662  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.42 
 
 		 301 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5518  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4369  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.536466  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3821  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.04 
 
 		 301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4343  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7048  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3779  LysR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 310 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152286 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4167  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 300 aa  113  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1935  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 307 aa  113  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4460  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 308 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031991 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8014  transcriptional regulator, LysR family  29.79 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4993  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0133249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4387  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8309  transcriptional regulator LysR family  30.38 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3837  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.65 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4236  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 306 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5703  transcriptional regulator, LysR family  27.03 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.351778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1838  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 318 aa  109  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.69135 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5993  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 304 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.248146 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6063  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0007  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.378538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5699  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6547  LysR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.94219  normal  0.418859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4348  LysR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2699  LysR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.133782  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6343  transcriptional regulator, LysR family  30.42 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2435  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.736044 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2808  transcriptional regulator, LysR family  26.82 
 
 		 316 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2069  LysR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.156662 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3487  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.24 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4381  LysR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4442  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 334 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal  0.600336 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6146  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.69148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2536  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  25.09 
 
 		 329 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.941748  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3109  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.129161 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0571  LysR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3464  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.26806  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2788  LysR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2760  transcriptional regulator, LysR family  26.82 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.436538 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2357  transcriptional regulator, LysR family  26.82 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0418601  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1819  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 309 aa  99.8  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.321718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2620  transcriptional regulator, LysR family  27.57 
 
 		 299 aa  99  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0513234  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0851  transcriptional regulator, LysR family  27.69 
 
 		 311 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2497  transcription regulator protein  27.06 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.82783  normal  0.625013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2111  LysR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3626  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.86 
 
 		 306 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5821  LysR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430138  normal  0.815813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2190  LysR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769998 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0014  transcriptional regulator, LysR family  29.1 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0014  transcriptional regulator, LysR family  29.51 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.12063  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5291  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 303 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2988  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.86 
 
 		 311 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0261246 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6967  transcriptional regulator, LysR family  26.55 
 
 		 303 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0067  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02687  DNA-binding transcriptional dual regulator  27.27 
 
 		 311 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3161  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.27 
 
 		 311 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0876  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.27 
 
 		 311 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1544  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 300 aa  96.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1142  LysR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2986  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.27 
 
 		 311 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02648  hypothetical protein  27.27 
 
 		 311 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3022  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.86 
 
 		 311 aa  96.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4203  LysR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 306 aa  96.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0212  transcriptional activator LysR  25.28 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1998  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 299 aa  95.9  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4109  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.86 
 
 		 311 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000450007 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4408  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.830984  normal  0.0872893 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0050  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3285  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.86 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0732  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.27 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5825  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1023  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.59 
 
 		 313 aa  93.2  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4453  LysR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 307 aa  93.2  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  hitchhiker  0.0000436239 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>