More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2877 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2877  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 314 aa  645    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0715401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000034  transcriptional regulator LysR family protein  30.56 
 
 		 304 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000511263  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5703  transcriptional regulator, LysR family  27.7 
 
 		 295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.351778 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2808  transcriptional regulator, LysR family  28.14 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2536  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.54 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.941748  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2094  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0354  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 310 aa  106  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2001  LysR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 308 aa  105  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0139  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7088  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.7 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0668  transcriptional regulator, LysR family  28.16 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0273303  normal  0.212728 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5518  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0157  transcriptional regulator, LysR family  30.28 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2069  LysR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.156662 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2536  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 357 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8014  transcriptional regulator, LysR family  30.65 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3487  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.9 
 
 		 307 aa  102  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2704  Transcriptional regulator  24.22 
 
 		 304 aa  102  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3626  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.89 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3464  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.26806  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4460  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031991 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3821  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.55 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1023  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.52 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3251  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.52 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000182985 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3726  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.27 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0970  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.52 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5316  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5108  transcriptional regulator, LysR family  28.31 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00133603 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3109  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.129161 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4343  LysR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 301 aa  99.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3634  LysR family transcriptional regulator  24.13 
 
 		 304 aa  100  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.246418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1589  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.43 
 
 		 311 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.963842  normal  0.282156 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2078  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.43 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.135243 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0838  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.56 
 
 		 304 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.101081 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3662  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.43 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3073  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4395  LysR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.322468  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.56 
 
 		 304 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.0310844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4770  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.56 
 
 		 304 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4421  LysR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 304 aa  97.1  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.655491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2081  transcriptional regulator, LysR family  27.78 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1795  transcriptional regulator, LysR family  26.62 
 
 		 321 aa  96.7  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130136  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1880  transcription regulator protein  27.49 
 
 		 324 aa  96.3  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1758  transcriptional regulator, LysR family  26.83 
 
 		 324 aa  95.9  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068602  normal  0.477555 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0094  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 326 aa  95.9  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22128 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4882  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.86 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3285  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.69 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5103  LysR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 403 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3484  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.86 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.657517  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5404  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.86 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02687  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.38 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4109  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.38 
 
 		 311 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000450007 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02648  hypothetical protein  26.38 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3161  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.38 
 
 		 311 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3022  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.98 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0876  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.38 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2986  DNA-binding transcriptional regulator LysR  26.38 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0851  transcriptional regulator, LysR family  26.38 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2909  transcriptional regulator, LysR family  30.86 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0304015  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3296  putative transcriptional regulator  26.85 
 
 		 306 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2988  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.98 
 
 		 311 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0261246 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0752  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.97 
 
 		 306 aa  92.8  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0319733  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0835  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 364 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.643048  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0148  LysR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 309 aa  92.4  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0716986  decreased coverage  0.0000000188935 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3837  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.17 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1671  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0091  transcriptional regulator, LysR family  29.46 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3014  LysR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3938  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 337 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5998  LysR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 304 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0589  LysR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 297 aa  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4167  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 300 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3582  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.938584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0199  LysR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.493239 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4348  LysR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0101  transcriptional regulator, LysR family  29.77 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0212  transcriptional activator LysR  27.37 
 
 		 311 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6292  transcriptional regulator, LysR family  27.44 
 
 		 303 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3639  transcriptional regulator, LysR family  26.25 
 
 		 297 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.958787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2077  LysR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1450  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 349 aa  89  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308203  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5618  transcriptional regulator, LysR family  23.29 
 
 		 300 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000121214 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2930  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2182  LysR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3928  transcriptional regulator, LysR family  26.25 
 
 		 297 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2619  LysR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 297 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2041  LysR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2620  transcriptional regulator, LysR family  27.93 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0513234  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2713  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.08 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0732  DNA-binding transcriptional regulator LysR  25.44 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6638  transcriptional regulator, LysR family  25.99 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.863309  normal  0.341434 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1898  transcriptional regulator, LysR family  26.49 
 
 		 322 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113483  normal  0.573852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1141  LysR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 297 aa  87  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387698 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0394  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 286 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780233  normal  0.51441 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0084  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446413  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>