More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3140 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3140  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
295 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2928  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3211  transcriptional regulator, LysR family  38.72 
 
 
290 aa  239  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  36.97 
 
 
288 aa  198  7.999999999999999e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19930  transcriptional regulator  31.96 
 
 
294 aa  168  9e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169185  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2462  transcriptional regulator, LysR family  31.38 
 
 
294 aa  167  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.341726  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0412  transcriptional regulator  34.57 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0159161  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1778  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
289 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000761412  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03270  transcriptional regulator  29.79 
 
 
305 aa  163  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1916  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
289 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0657607  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2000  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
289 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.504431  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1757  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
289 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2919  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
290 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226862  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1735  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
289 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3423  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 
289 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000235779 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1790  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 
289 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000399419  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3185  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  0.982451 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1952  transcriptional regulator, LysR family  31.03 
 
 
263 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018508 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2021  transcriptional regulator, LysR family  31.03 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000475915  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0673  LysR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.102205  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1920  transcriptional regulator, LysR family  31.03 
 
 
263 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.304852  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2850  LysR family substrate binding transcriptional regulator  30.53 
 
 
290 aa  125  8.000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.46504  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  28.2 
 
 
327 aa  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  28.42 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  25.9 
 
 
309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  28.01 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  27.68 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1680  LysR family transcriptional regulator  27.14 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.21592  normal  0.237518 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2390  LysR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
299 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0084  LysR family transcriptional regulator  26.96 
 
 
311 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446413  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1279  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
310 aa  116  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5225  transcriptional regulator, LysR family  26.09 
 
 
316 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5818  LysR family transcriptional regulator  26.24 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3373  hypothetical protein  29.35 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3883  LysR family transcriptional regulator  26.24 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  27.34 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0091  transcriptional regulator, LysR family  26.62 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4486  LysR family transcriptional regulator  26.24 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4995  LysR family transcriptional regulator  26.3 
 
 
302 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.631415  normal  0.721068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  24.9 
 
 
305 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  27.78 
 
 
297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1864  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 
294 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  27.11 
 
 
310 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3922  LysR family transcriptional regulator  26.39 
 
 
298 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2935  transcriptional regulator, LysR family  26.51 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3380  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 
299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0953  transcriptional regulator, LysR family  28.29 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0101  transcriptional regulator, LysR family  26.28 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2848  LysR family transcriptional regulator  24.67 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93078  normal  0.0328698 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4386  LysR family transcriptional regulator  27.09 
 
 
303 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.343439  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1368  LysR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
304 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1389  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
295 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148304  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  29.44 
 
 
295 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  27.24 
 
 
316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0868  fhu operon transcriptional regulator  26.74 
 
 
321 aa  108  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5293  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
297 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.382002 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2736  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  25.08 
 
 
294 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4318  LysR family transcriptional regulator  24.92 
 
 
302 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.772143  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  25.41 
 
 
306 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1120  transcriptional regulator, LysR family  25.45 
 
 
350 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  27.11 
 
 
311 aa  106  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1224  LysR family transcriptional regulator  27.55 
 
 
289 aa  106  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1277  transcriptional regulator, LysR family  28.57 
 
 
282 aa  105  7e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0309  transcriptional regulator, LysR family protein  30.43 
 
 
289 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2826  LysR family transcriptional regulator  26.22 
 
 
300 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
300 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  24.58 
 
 
301 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3755  LysR substrate-binding  29.32 
 
 
294 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6323  MarR family transcriptional regulator  26.02 
 
 
294 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482978  normal  0.771209 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0497  LysR family transcriptional regulator  26.42 
 
 
294 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479645  normal  0.474406 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2418  transcriptional regulator  27.08 
 
 
294 aa  103  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0285418 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  23.05 
 
 
298 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0382  transcriptional regulator, LysR family  26.34 
 
 
302 aa  102  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 
308 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 
308 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3435  LysR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
295 aa  102  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107817  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2801  transcriptional regulator, substrate-binding, LysR family protein  26.95 
 
 
294 aa  102  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  23.75 
 
 
298 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0038  transcriptional regulator, LysR family  25.61 
 
 
300 aa  102  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.744574 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0037  transcriptional regulator, LysR family  25.61 
 
 
300 aa  102  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.279269  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5024  LysR family transcriptional regulator  27.95 
 
 
311 aa  102  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0432035  normal  0.889367 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1626  transcriptional regulator, LysR family  27.08 
 
 
300 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0614386 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1388  LysR family transcriptional regulator  25.51 
 
 
310 aa  102  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3561  LysR family transcriptional regulator  24.5 
 
 
297 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3090  transcriptional regulator, LysR family  21.72 
 
 
283 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  23.45 
 
 
298 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3249  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 
297 aa  102  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2830  LysR family transcriptional regulator  24.8 
 
 
303 aa  102  9e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0699  LysR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
295 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3323  LysR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
295 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0711414  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6292  transcriptional regulator, LysR family  25.2 
 
 
303 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  23.81 
 
 
308 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>