More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2560 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2560  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 325 aa  634    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000128008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2847  LysR family transcriptional regulator  75.99 
 
 		 327 aa  457  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02580  transcriptional regulator  45.82 
 
 		 309 aa  208  8e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2214  transcriptional regulator, LysR family  40.9 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00637243  hitchhiker  0.0000100352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06400  transcriptional regulator  42.16 
 
 		 305 aa  172  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.450023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1381  transcriptional regulator, LysR family  39.86 
 
 		 300 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0155943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  33.46 
 
 		 300 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  34.73 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0112  transcriptional regulator, LysR family  38.84 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.262181  normal  0.0290414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0790  transcriptional regulator, LysR family  37.72 
 
 		 361 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156253  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4722  transcriptional regulator, LysR family  37.3 
 
 		 301 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5069  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5454  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533779  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0641  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 309 aa  132  6e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4901  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 294 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5618  transcriptional regulator, LysR family  29.05 
 
 		 300 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000121214 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1275  transcriptional regulator, LysR family  37.59 
 
 		 291 aa  129  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5392  transcriptional regulator, LysR family  29.39 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4914  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5341  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5310  transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1453799999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  31.96 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5335  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 294 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5012  LysR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4029  transcriptional regulator, LysR family  35.11 
 
 		 299 aa  113  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185534  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  33.91 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  36.4 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5650  transcriptional regulator, LysR family  30.14 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1383  transcriptional regulator, LysR family  29.51 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4603  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 294 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3362  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 301 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0184586  normal  0.124308 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0157  transcriptional regulator, LysR family  32.01 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0147  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0139  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1774  transcriptional regulator CysB-like protein  26.59 
 
 		 309 aa  99.8  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3664  transcriptional regulator, LysR family  34.6 
 
 		 308 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  22.57 
 
 		 295 aa  99.4  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1225  LysR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 306 aa  99  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2418  transcriptional regulator, LysR family  28.19 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2682  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3771  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 312 aa  96.7  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.368263  normal  0.0120548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  32.21 
 
 		 298 aa  96.7  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0341  transcriptional regulator CysB  29.69 
 
 		 333 aa  96.7  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3260  LysR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 305 aa  95.9  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.444883 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  31.14 
 
 		 301 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1979  transcriptional regulator CysB  25.1 
 
 		 323 aa  94.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1547  LysR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1113  transcriptional regulator, LysR family  29.96 
 
 		 311 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1888  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0586  LysR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.364179  decreased coverage  0.000128837 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2876  LysR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.692087 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1236  transcriptional regulator CysB-like protein  25.91 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0650048  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  30.66 
 
 		 298 aa  93.6  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2053  LysR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.79519  normal  0.0937075 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1155  transcriptional regulator CysB-like protein  25.93 
 
 		 309 aa  94  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000427804  normal  0.581865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 292 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  31.67 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1001  LysR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 303 aa  92.8  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2172  transcriptional regulator, LysR family  30.34 
 
 		 290 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19930  transcriptional regulator  30.2 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0390  transcriptional regulator, LysR family  34.65 
 
 		 293 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3775  LysR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3234  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.18 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.842433  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0528  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454001 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1279  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 310 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3323  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0711414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0551  transcriptional regulator, LysR family protein  25.35 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  33.77 
 
 		 301 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6877  LysR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00333215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2604  transcriptional regulator, LysR family  28.75 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2482  LysR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086853  normal  0.0180215 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5108  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 311 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3618  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1767  transcriptional regulator, LysR family  25.17 
 
 		 297 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114066  normal  0.776401 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0699  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1268  putative HTH-type transcriptional regulator YbhD  27.49 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4749  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0228204 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2679  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3497  transcriptional regulator, substrate-binding, LysR family protein  25.36 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.794623  hitchhiker  0.0000380526 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1982  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.91 
 
 		 290 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08730  transcriptional regulator  28.08 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.188975 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3378  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 306 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587515  normal  0.118229 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  30.86 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>