More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1711 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 311 aa  608  1e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  92.93 
 
 		 311 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  61.04 
 
 		 310 aa  352  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 316 aa  340  1e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1120  transcriptional regulator, LysR family  55.65 
 
 		 350 aa  331  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  58.98 
 
 		 317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5225  transcriptional regulator, LysR family  58.09 
 
 		 316 aa  319  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  57.09 
 
 		 316 aa  312  3.9999999999999997e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1279  LysR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 310 aa  311  7.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  56.16 
 
 		 297 aa  301  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 298 aa  202  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  39.32 
 
 		 301 aa  189  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  31.62 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  31.1 
 
 		 300 aa  159  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 300 aa  158  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  30.27 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  31.09 
 
 		 300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  32.37 
 
 		 302 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  34.24 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  38.13 
 
 		 343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1389  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 305 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4335  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.385889  normal  0.337801 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  39.62 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3750  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0403  DNA-binding transcriptional regulator CynR  30.72 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0362  DNA-binding transcriptional regulator CynR  30.72 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2848  LysR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.93078  normal  0.0328698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0369  DNA-binding transcriptional regulator CynR  30.8 
 
 		 299 aa  142  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3287  DNA-binding transcriptional regulator CynR  30.8 
 
 		 299 aa  142  8e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0411  DNA-binding transcriptional regulator CynR  30.72 
 
 		 299 aa  142  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00292  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.8 
 
 		 299 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3268  transcriptional regulator, LysR family  30.8 
 
 		 299 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  37.68 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1224  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00296  hypothetical protein  30.8 
 
 		 299 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5618  transcriptional regulator, LysR family  29.77 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000121214 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  33.58 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  37.68 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  38.46 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3802  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.238076  normal  0.337014 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 305 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1535  DNA-binding transcriptional regulator CynR  31.39 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.195582  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2850  LysR family substrate binding transcriptional regulator  31.96 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.46504  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2058  transcriptional regulator, LysR family  38.37 
 
 		 299 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90545  hitchhiker  0.00248149 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2161  LysR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 299 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0803244  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  36.12 
 
 		 301 aa  138  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  36.23 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3895  LysR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958573  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0274  hypothetical protein  30.33 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3794  transcriptional regulator, LysR family  34.17 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.689518 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1053  transcriptional regulator, LysR family  37.12 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262564  normal  0.905939 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7124  transcriptional regulator, LysR family  38.82 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.281926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2736  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  32.37 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  34.2 
 
 		 302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1250  transcriptional regulator, LysR family  36.88 
 
 		 311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0513927 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1626  transcriptional regulator, LysR family  32.4 
 
 		 300 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0614386 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5335  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 294 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5585  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 298 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 323 aa  135  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7208  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 293 aa  135  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3509  LysR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 319 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633276 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0445  LysR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0269  hypothetical protein  30 
 
 		 294 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5056  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  38.4 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1392  LysR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0389535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0352  transcriptional regulator, LysR family  37.59 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2826  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1408  LysR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3379  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1374  LysR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4988  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5299  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 290 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0530813 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4914  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0828  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  36.33 
 
 		 320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.767447  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5392  transcriptional regulator, LysR family  29.43 
 
 		 294 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0380  transcriptional regulator LysR family  33.56 
 
 		 309 aa  132  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2265  LysR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 292 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2155  LysR family substrate binding transcriptional regulator  38.25 
 
 		 292 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.971753  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5341  transcriptional regulator, LysR family  29.1 
 
 		 294 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 293 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3939  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 320 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5012  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 294 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2215  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 314 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  34.36 
 
 		 298 aa  132  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4901  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3363  hypothetical protein  36.47 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354704  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3465  hypothetical protein  36.47 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3370  hypothetical protein  36.47 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.570732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>