More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3362 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3362  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  584  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0184586  normal  0.124308 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  76.24 
 
 		 303 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3027  LysR family transcriptional regulator  60.63 
 
 		 296 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  0.0983391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3012  LysR family transcriptional regulator  59.93 
 
 		 296 aa  308  5e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3058  LysR family transcriptional regulator  59.93 
 
 		 296 aa  308  5e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  54.18 
 
 		 343 aa  254  8e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5025  transcriptional regulator, LysR family  51.65 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.860643  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1618  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4879  transcriptional regulator, LysR family  50 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1536  LysR, substrate-binding  43.57 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1478  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0854082  hitchhiker  0.000187974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0276  transcriptional regulator, LysR family  39.66 
 
 		 295 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265614 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18090  transcriptional regulator, LysR family  47.79 
 
 		 319 aa  169  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.502124  normal  0.864979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4229  putative LysR family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552994  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3051  transcriptional regulator, LysR family  45.07 
 
 		 285 aa  162  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32995  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4609  transcriptional regulator, LysR family  42.97 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.461419 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3737  LysR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.440992 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1281  transcriptional regulator, LysR family  42.97 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20663  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1045  transcriptional regulator, LysR family  38.85 
 
 		 303 aa  152  8.999999999999999e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3861  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378583  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0352  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 		 296 aa  149  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2830  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 303 aa  148  8e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1427  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0328  LysR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 299 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280372 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1670  LysR substrate-binding protein  39.38 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.903503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5293  LysR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 297 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382002 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 310 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  36.73 
 
 		 302 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4901  LysR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0390  transcriptional regulator, LysR family  39.84 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  33.86 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  33.47 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  35.62 
 
 		 290 aa  136  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4718  hydrogen peroxide-inducible genes activator  33.6 
 
 		 299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 323 aa  135  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  39.29 
 
 		 295 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 306 aa  135  9e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3234  DNA-binding transcriptional regulator CynR  36.93 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.842433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 317 aa  133  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  30.92 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5069  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 294 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5454  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 294 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3380  transcriptional regulator, LysR family  37.59 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5618  transcriptional regulator, LysR family  30.04 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000121214 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  35.37 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5949  DNA-binding transcriptional regulator CynR  35.32 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233312  normal  0.638196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3378  transcriptional regulator, LysR family  38.06 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587515  normal  0.118229 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5012  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  30.92 
 
 		 300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5705  DNA-binding transcriptional regulator CynR  34.94 
 
 		 295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.202456 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4914  LysR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 294 aa  129  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5335  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 294 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1279  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 310 aa  129  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0836  transcriptional regulator, LysR family  31.5 
 
 		 304 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.192255  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  36.79 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  35.52 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5392  transcriptional regulator, LysR family  28.07 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1120  transcriptional regulator, LysR family  36.94 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2850  LysR family substrate binding transcriptional regulator  27.37 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.46504  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  32.24 
 
 		 300 aa  126  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 301 aa  126  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1672  LysR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 295 aa  125  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5341  transcriptional regulator, LysR family  29.34 
 
 		 294 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0369  DNA-binding transcriptional regulator CynR  34.35 
 
 		 299 aa  125  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5585  LysR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 298 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0403  DNA-binding transcriptional regulator CynR  34.35 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0362  DNA-binding transcriptional regulator CynR  34.35 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49340  LysR family transcriptional regulator protein  34.25 
 
 		 312 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4070  LysR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.409277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3319  transcriptional regulator, LysR family  31.65 
 
 		 310 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  32.97 
 
 		 316 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00292  DNA-binding transcriptional dual regulator  33.97 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3268  transcriptional regulator, LysR family  33.97 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2058  transcriptional regulator, LysR family  35.93 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90545  hitchhiker  0.00248149 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3287  DNA-binding transcriptional regulator CynR  34.35 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00296  hypothetical protein  33.97 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0445  LysR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4628  transcriptional regulator, LysR family  38.34 
 
 		 292 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0890971  normal  0.246233 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1535  DNA-binding transcriptional regulator CynR  33.46 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.195582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1250  transcriptional regulator, LysR family  41.2 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0513927 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 319 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 307 aa  122  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1113  transcriptional regulator, LysR family  33.66 
 
 		 311 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3561  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0033  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000417374  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02139  transcriptional regulator  27.94 
 
 		 289 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40910  LysR family transcriptional regulatory protein  35.77 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5310  transcriptional regulator, LysR family  28.93 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1453799999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0411  DNA-binding transcriptional regulator CynR  34.34 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>