More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_49340 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_49340  LysR family transcriptional regulator protein  100 
 
 		 312 aa  619  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2608  LysR family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 300 aa  276  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6619  transcriptional regulator, LysR family  53.41 
 
 		 300 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1893  LysR family transcriptional regulator  51.59 
 
 		 309 aa  268  8.999999999999999e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3534  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 302 aa  261  8e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0380  transcriptional regulator LysR family  45.05 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  45.27 
 
 		 295 aa  228  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  44.07 
 
 		 302 aa  226  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4628  transcriptional regulator, LysR family  45.76 
 
 		 292 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0890971  normal  0.246233 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2326  LysR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 306 aa  222  7e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5074  transcriptional regulator, LysR family  41.45 
 
 		 307 aa  222  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.507053 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3404  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.729223  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0445  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  42.09 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3509  LysR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 319 aa  210  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633276 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 305 aa  209  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1053  transcriptional regulator, LysR family  41.49 
 
 		 310 aa  209  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262564  normal  0.905939 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  38.93 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 302 aa  209  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2161  LysR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 299 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0803244  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  38.93 
 
 		 301 aa  208  8e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  38.93 
 
 		 299 aa  208  8e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  38.93 
 
 		 299 aa  208  8e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  38.93 
 
 		 301 aa  208  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 301 aa  208  9e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 301 aa  208  9e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 295 aa  208  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  38.93 
 
 		 301 aa  208  9e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  38.93 
 
 		 301 aa  208  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  42.33 
 
 		 298 aa  205  7e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2058  transcriptional regulator, LysR family  40.52 
 
 		 299 aa  205  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90545  hitchhiker  0.00248149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2155  LysR family substrate binding transcriptional regulator  40.61 
 
 		 292 aa  201  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.971753  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2265  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 292 aa  201  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5111  transcriptional regulator, LysR family  42.03 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  41.83 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5585  LysR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0421  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.03 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  41.48 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  41.69 
 
 		 302 aa  198  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  42.9 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2119  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  40.61 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3370  hypothetical protein  39.93 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3363  hypothetical protein  39.93 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354704  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3465  hypothetical protein  39.93 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  45.8 
 
 		 296 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 298 aa  192  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0395  LysR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  45.42 
 
 		 296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3296  StmR  39.93 
 
 		 292 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.618402 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2332  transcriptional regulator, LysR family  38.03 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.194223  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1969  transcriptional regulator, LysR family  38.03 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  39.25 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2043  transcriptional regulator, LysR family  40.52 
 
 		 298 aa  186  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2134  transcriptional regulator, LysR family  40.45 
 
 		 304 aa  186  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1897  transcriptional regulator, LysR family  38.95 
 
 		 304 aa  185  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5299  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 290 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0530813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 318 aa  185  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.91 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  38.91 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  38.91 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4988  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3379  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5353  LysR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  38.91 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  37.69 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3319  transcriptional regulator, LysR family  33.89 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2344  transcriptional regulator, LysR family  39.78 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1250  transcriptional regulator, LysR family  42.54 
 
 		 311 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0513927 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4401  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 305 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2025  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 293 aa  179  7e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.639957  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4411  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 291 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0509478  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  37.87 
 
 		 294 aa  178  8e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3948  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 291 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  39.4 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  37.38 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3441  transcriptional regulator, LysR family  34.33 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2282  LysR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0266423 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2466  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 304 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 289 aa  176  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>