More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0328 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0328  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  585  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3380  transcriptional regulator, LysR family  38.05 
 
 		 299 aa  152  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3012  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 296 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3058  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 296 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3027  LysR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  0.0983391 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3737  LysR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.440992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3362  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 301 aa  142  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0184586  normal  0.124308 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4879  transcriptional regulator, LysR family  41.57 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1478  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0854082  hitchhiker  0.000187974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5293  LysR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382002 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2830  LysR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3861  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378583  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18090  transcriptional regulator, LysR family  37.4 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.502124  normal  0.864979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1427  LysR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0276  transcriptional regulator, LysR family  37.09 
 
 		 295 aa  126  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265614 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  31.44 
 
 		 300 aa  125  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 305 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  36.69 
 
 		 343 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  31.77 
 
 		 300 aa  123  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3378  transcriptional regulator, LysR family  36.73 
 
 		 306 aa  122  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587515  normal  0.118229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1536  LysR, substrate-binding  34.92 
 
 		 294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1618  LysR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0390  transcriptional regulator, LysR family  38.65 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1281  transcriptional regulator, LysR family  33.69 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.20663  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3051  transcriptional regulator, LysR family  37.79 
 
 		 285 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32995  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5650  transcriptional regulator, LysR family  31.91 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3308  transcriptional regulator, LysR family  41.59 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5025  transcriptional regulator, LysR family  33.2 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.860643  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2077  transcriptional regulator, LysR family  38.37 
 
 		 302 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4229  putative LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552994  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1670  LysR substrate-binding protein  32.83 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.903503  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  33.21 
 
 		 301 aa  112  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4044  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 307 aa  112  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.114171 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  36.32 
 
 		 290 aa  112  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2157  LysR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  30.59 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2134  transcriptional regulator, LysR family  29.97 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  30.08 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2282  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0266423 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  31.17 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  31.13 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.13 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  31.13 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  31.13 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 297 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 301 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2554  transcriptional regulator, LysR family  33.94 
 
 		 309 aa  108  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0664958  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 297 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  31.13 
 
 		 297 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4609  transcriptional regulator, LysR family  29.77 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.461419 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  32.13 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  35.27 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  36.11 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0746  transcriptional regulator, LysR family  37.78 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  39.06 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003682  transcriptional regulator LysR family  32.59 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2145  DNA-binding transcriptional regulator CynR  31.95 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.276237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5606  DNA-binding transcriptional regulator CynR  33.71 
 
 		 328 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4789  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  32.28 
 
 		 292 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0620  LysR, substrate-binding  33.91 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08961  transcriptional regulator, LysR family protein  26.84 
 
 		 312 aa  105  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5618  transcriptional regulator, LysR family  30.2 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000121214 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  35.83 
 
 		 295 aa  105  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1053  transcriptional regulator, LysR family  34.66 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262564  normal  0.905939 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1897  transcriptional regulator, LysR family  28.95 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02139  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2482  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086853  normal  0.0180215 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0641  transcriptional regulator, LysR family  30.8 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0586  LysR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.364179  decreased coverage  0.000128837 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2118  LysR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0157  transcriptional regulator, LysR family  35.27 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7097  transcriptional regulator, LysR family  35.66 
 
 		 296 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.785925  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1657  LysR substrate binding domain-containing protein  30.03 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1598  LysR substrate binding domain protein  30.03 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1852  LysR substrate binding domain-containing protein  30.03 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1685  LysR substrate binding domain protein  30.03 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.533068  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 319 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1589  LysR substrate binding domain protein  30.03 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  34.47 
 
 		 298 aa  102  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2120  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.112359  normal  0.184045 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4012  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 298 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  33.72 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  33.59 
 
 		 301 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  32 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1279  LysR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 310 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2850  LysR family substrate binding transcriptional regulator  30.04 
 
 		 290 aa  102  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.46504  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3234  DNA-binding transcriptional regulator CynR  32.95 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.842433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>