More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3091 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 304 aa  595  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  48.5 
 
 		 301 aa  255  7e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  46.64 
 
 		 298 aa  243  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  41.78 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 305 aa  229  4e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  41.78 
 
 		 301 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  41.78 
 
 		 301 aa  229  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  41.78 
 
 		 301 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 301 aa  229  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 301 aa  229  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  41.78 
 
 		 301 aa  229  6e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  41.78 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  41.78 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 302 aa  226  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1296  transcriptional regulator, LysR family  44.67 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.502339  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 296 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  43.15 
 
 		 294 aa  216  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 298 aa  216  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  40.61 
 
 		 292 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 306 aa  216  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1392  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 306 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0389535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2554  transcriptional regulator, LysR family  44.59 
 
 		 309 aa  209  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0664958  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1374  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 314 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1408  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 323 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1027  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 299 aa  208  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174873 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1356  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 329 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal  0.0413241 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  41.81 
 
 		 289 aa  205  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  45.17 
 
 		 296 aa  205  9e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1346  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.638115  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2682  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3179  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  41.84 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2537  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 296 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2671  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0656105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0664  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3750  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1775  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310759  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  40.14 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.97 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  40.97 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  40.97 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 303 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  40.97 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 303 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 297 aa  192  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 301 aa  192  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 296 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  40.97 
 
 		 297 aa  192  8e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  46.56 
 
 		 296 aa  191  9e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 323 aa  191  9e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  39.24 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  40.77 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2134  transcriptional regulator, LysR family  39.85 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1400  LysR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  40 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2155  LysR family substrate binding transcriptional regulator  40.75 
 
 		 292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.971753  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1969  transcriptional regulator, LysR family  38.91 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2265  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2332  transcriptional regulator, LysR family  38.91 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.194223  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  40.48 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  46.18 
 
 		 296 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0834  LysR, substrate-binding  39.58 
 
 		 330 aa  189  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4425  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 302 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3962  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 302 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195836  normal  0.175267 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4630  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 295 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  hitchhiker  0.000277503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1308  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  42.96 
 
 		 308 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0186  transcriptional regulator, LysR family  38.49 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.925738  normal  0.858916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  40.83 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4123  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.454072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 299 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3612  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 296 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.395284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2282  LysR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0266423 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 301 aa  185  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 297 aa  185  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0395  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 299 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2154  transcriptional regulator, LysR family  39.86 
 
 		 295 aa  185  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 305 aa  185  8e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 299 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0639  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6486  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2107  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4207  LysR substrate-binding protein  37.63 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3831  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4537  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2740  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.379655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>