More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B1538 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 
299 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 
299 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  99 
 
 
301 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  99 
 
 
301 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  99 
 
 
301 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  99 
 
 
301 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  99 
 
 
301 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  98.66 
 
 
301 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  98.33 
 
 
301 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  97.99 
 
 
302 aa  597  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  92.64 
 
 
305 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  47.75 
 
 
292 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  45.86 
 
 
298 aa  272  5.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  44.95 
 
 
298 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  46.71 
 
 
295 aa  268  7e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 
296 aa  262  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  44.63 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  42.96 
 
 
323 aa  248  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
296 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  46.04 
 
 
299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  45.56 
 
 
296 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  46.04 
 
 
299 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  45.32 
 
 
299 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 
293 aa  239  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0395  LysR family transcriptional regulator  44.94 
 
 
299 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  45.17 
 
 
296 aa  238  8e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  43.45 
 
 
296 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  42.96 
 
 
301 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 
301 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  43.39 
 
 
298 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5111  transcriptional regulator, LysR family  42.76 
 
 
297 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
305 aa  229  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0421  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.76 
 
 
296 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.52 
 
 
300 aa  228  9e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
297 aa  226  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
300 aa  225  8e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  39.37 
 
 
289 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2740  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 
297 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 
306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2752  transcriptional regulator, LysR family  39.31 
 
 
298 aa  222  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000767643 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2043  transcriptional regulator, LysR family  44.24 
 
 
298 aa  222  7e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  43.01 
 
 
295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
301 aa  219  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2344  transcriptional regulator, LysR family  43.88 
 
 
298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 
302 aa  218  7e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  39.12 
 
 
306 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05669  transcription regulator protein  39.12 
 
 
306 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2265  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
292 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2155  LysR family substrate binding transcriptional regulator  38.33 
 
 
292 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.971753  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2134  transcriptional regulator, LysR family  39.54 
 
 
304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
303 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
303 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  39.36 
 
 
304 aa  215  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
304 aa  215  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  41.78 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5585  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3750  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5792  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 
304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0380  transcriptional regulator LysR family  39.8 
 
 
309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 
299 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1400  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
303 aa  212  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  39.27 
 
 
297 aa  211  7.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3633  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
328 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 
302 aa  211  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1181  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  39.13 
 
 
331 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  42.11 
 
 
295 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  39.12 
 
 
302 aa  210  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1346  LysR family transcriptional regulator  40.57 
 
 
294 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.638115  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0989  transcriptional regulator, LysR family  39.87 
 
 
321 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1134  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 
294 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  42.6 
 
 
301 aa  209  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  39.37 
 
 
301 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2282  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 
302 aa  209  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0266423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2058  transcriptional regulator, LysR family  35.59 
 
 
299 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90545  hitchhiker  0.00248149 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1021  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  38.36 
 
 
337 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127351  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2161  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 
299 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0803244  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  40.53 
 
 
316 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49340  LysR family transcriptional regulator protein  38.93 
 
 
312 aa  208  8e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 
296 aa  208  9e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 
306 aa  208  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
306 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  38.91 
 
 
294 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1897  transcriptional regulator, LysR family  39.14 
 
 
304 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0828  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  39.19 
 
 
320 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.767447  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 
318 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.29 
 
 
293 aa  205  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2411  transcription regulator protein  40.85 
 
 
311 aa  205  7e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0833  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 
304 aa  205  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1028  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  38.08 
 
 
331 aa  205  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2333  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  38.57 
 
 
315 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0128681  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0678  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  38.57 
 
 
315 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1852  LysR substrate binding domain-containing protein  40.58 
 
 
299 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1589  LysR substrate binding domain protein  40.58 
 
 
299 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2953  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  38.57 
 
 
329 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0041469  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1685  LysR substrate binding domain protein  40.58 
 
 
299 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.533068  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1646  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  38.57 
 
 
315 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.636647  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1598  LysR substrate binding domain protein  40.58 
 
 
299 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>