More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1589 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1685  LysR substrate binding domain protein  100 
 
 
299 aa  607  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.533068  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1589  LysR substrate binding domain protein  100 
 
 
299 aa  607  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1657  LysR substrate binding domain-containing protein  100 
 
 
299 aa  607  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1852  LysR substrate binding domain-containing protein  100 
 
 
299 aa  607  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1598  LysR substrate binding domain protein  100 
 
 
299 aa  607  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  84.64 
 
 
297 aa  507  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  83.84 
 
 
297 aa  504  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  83.16 
 
 
297 aa  500  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  83.16 
 
 
297 aa  500  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  83.5 
 
 
297 aa  502  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  83.16 
 
 
297 aa  500  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  83.5 
 
 
297 aa  502  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  83.16 
 
 
297 aa  500  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  83.16 
 
 
297 aa  500  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  83.5 
 
 
297 aa  502  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1897  transcriptional regulator, LysR family  59.47 
 
 
304 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2043  transcriptional regulator, LysR family  60.47 
 
 
298 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2344  transcriptional regulator, LysR family  60.81 
 
 
298 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2134  transcriptional regulator, LysR family  57.97 
 
 
304 aa  351  8.999999999999999e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2282  LysR family transcriptional regulator  56.95 
 
 
302 aa  329  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0266423 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  57.86 
 
 
304 aa  326  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  57.86 
 
 
304 aa  326  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  51.37 
 
 
301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  51.03 
 
 
301 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0395  LysR family transcriptional regulator  51.01 
 
 
299 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  51.01 
 
 
299 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 
299 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 
298 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  50.67 
 
 
299 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5111  transcriptional regulator, LysR family  49.32 
 
 
297 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  50 
 
 
308 aa  269  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0421  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  48.97 
 
 
296 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2332  transcriptional regulator, LysR family  43.57 
 
 
308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.194223  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1969  transcriptional regulator, LysR family  43.57 
 
 
308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  42.24 
 
 
306 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05669  transcription regulator protein  42.24 
 
 
306 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  42.31 
 
 
292 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  42.81 
 
 
294 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0186  transcriptional regulator, LysR family  44.44 
 
 
302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.925738  normal  0.858916 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
297 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3722  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
307 aa  210  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2554  transcriptional regulator, LysR family  47.76 
 
 
309 aa  208  9e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0664958  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
302 aa  205  8e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  40.58 
 
 
301 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  40.58 
 
 
301 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
301 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
301 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  39.16 
 
 
299 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  40.58 
 
 
299 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  40.58 
 
 
301 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  40.58 
 
 
301 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  40.58 
 
 
299 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  40.58 
 
 
301 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  39.64 
 
 
305 aa  203  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  39.43 
 
 
307 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  41.45 
 
 
298 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 
306 aa  199  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
295 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  43.7 
 
 
296 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  43.63 
 
 
295 aa  193  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
298 aa  192  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  41.28 
 
 
296 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  43.7 
 
 
296 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  41.3 
 
 
302 aa  191  9e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3750  LysR family transcriptional regulator  41.2 
 
 
297 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
296 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6486  LysR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
301 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
289 aa  188  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2752  transcriptional regulator, LysR family  35.66 
 
 
298 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000767643 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4123  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
302 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.454072 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4425  LysR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
302 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
305 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3962  LysR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
302 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195836  normal  0.175267 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  37.73 
 
 
302 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1308  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
302 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4202  LysR family transcriptional regulator  39.35 
 
 
295 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.932359  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3831  LysR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
302 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4628  transcriptional regulator, LysR family  39.18 
 
 
292 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0890971  normal  0.246233 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4537  LysR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
302 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4649  LysR family transcriptional regulator  39.35 
 
 
315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235656  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  37.05 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1250  transcriptional regulator, LysR family  39.53 
 
 
311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0513927 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0445  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  38.6 
 
 
308 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
318 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2265  LysR family transcriptional regulator  38.69 
 
 
292 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2155  LysR family substrate binding transcriptional regulator  38.69 
 
 
292 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.971753  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5585  LysR family transcriptional regulator  39.92 
 
 
298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0719  LysR family regulatory protein  37.09 
 
 
322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0714085  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  39.01 
 
 
316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2879  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 
307 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0550  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 
307 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3167  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 
307 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0532  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 
307 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.693788  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1451  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 
307 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870434  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0137  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 
307 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.750096  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
296 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0664  LysR family transcriptional regulator  36.56 
 
 
295 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0825274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>