More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3750 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3750  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
297 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  41.87 
 
 
295 aa  237  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  40.41 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 
298 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  38.97 
 
 
301 aa  222  7e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  38.97 
 
 
301 aa  221  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  47.75 
 
 
296 aa  221  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  38.97 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  38.97 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  38.97 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  38.97 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  38.97 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 
302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  42.21 
 
 
298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
306 aa  216  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
289 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
299 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  46.4 
 
 
296 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  41.4 
 
 
299 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  43.49 
 
 
323 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 
296 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  41.2 
 
 
307 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
297 aa  210  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  43.42 
 
 
306 aa  210  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05669  transcription regulator protein  43.42 
 
 
306 aa  210  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  42.41 
 
 
301 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 
296 aa  209  4e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  41.05 
 
 
299 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  46.04 
 
 
296 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  42.56 
 
 
301 aa  208  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0395  LysR family transcriptional regulator  41.05 
 
 
299 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 
305 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  43.25 
 
 
297 aa  206  4e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  39.3 
 
 
293 aa  205  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
298 aa  205  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0421  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.4 
 
 
296 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
308 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2752  transcriptional regulator, LysR family  36.43 
 
 
298 aa  203  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000767643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5111  transcriptional regulator, LysR family  40.77 
 
 
297 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  39.31 
 
 
308 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  41.96 
 
 
308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  39.58 
 
 
301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
300 aa  198  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4970  transcriptional regulator, LysR family  40.7 
 
 
298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126085  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  41.34 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2649  transcriptional regulator  40.49 
 
 
300 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2782  LysR family regulatory protein  40.49 
 
 
300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105762  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2704  LysR family transcriptional regulator  40.49 
 
 
300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.995424  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1756  LysR family transcriptional regulator  40.49 
 
 
300 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.497412  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2265  LysR family transcriptional regulator  40.49 
 
 
300 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503277  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1538  LysR family transcriptional regulator  40.49 
 
 
300 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.337495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3053  LysR family transcriptional regulator  40.49 
 
 
300 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 
296 aa  195  9e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 
300 aa  195  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2421  LysR substrate-binding  31.74 
 
 
300 aa  194  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3722  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
307 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1134  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
294 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1832  LysR family transcriptional regulator  41.55 
 
 
300 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6115  transcriptional regulator, LysR family  40.48 
 
 
299 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0607  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
296 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.693427  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 
300 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  42.55 
 
 
301 aa  193  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0157  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
296 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0640  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
296 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
296 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1672  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 
295 aa  192  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57433  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2778  transcriptional regulator, LysR family  40.48 
 
 
302 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23055  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1598  LysR substrate binding domain protein  41.2 
 
 
299 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1852  LysR substrate binding domain-containing protein  41.2 
 
 
299 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1657  LysR substrate binding domain-containing protein  41.2 
 
 
299 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1589  LysR substrate binding domain protein  41.2 
 
 
299 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1685  LysR substrate binding domain protein  41.2 
 
 
299 aa  192  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.533068  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2058  transcriptional regulator, LysR family  36.71 
 
 
299 aa  191  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90545  hitchhiker  0.00248149 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 
300 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5585  LysR family transcriptional regulator  39.24 
 
 
298 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0544  transcriptional regulator, LysR family  42.41 
 
 
295 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2161  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 
299 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0803244  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  39.37 
 
 
308 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  39.37 
 
 
308 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6486  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 
301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3724  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
300 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  42.61 
 
 
304 aa  188  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2312  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
302 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015479  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0175  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 
302 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602241  normal  0.0372511 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4070  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 
297 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.409277  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2043  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 
298 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
302 aa  186  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  39.15 
 
 
302 aa  185  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0037  transcriptional regulator, LysR family  38.44 
 
 
300 aa  185  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.279269  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0038  transcriptional regulator, LysR family  38.44 
 
 
300 aa  185  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.744574 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2053  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
323 aa  185  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.79519  normal  0.0937075 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2134  transcriptional regulator, LysR family  40.15 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3370  hypothetical protein  36.55 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  40.22 
 
 
297 aa  183  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>