More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1405 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
302 aa  603  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3927  LysR family transcriptional regulator  62.38 
 
 
303 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1001  LysR family transcriptional regulator  63.29 
 
 
303 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  62.59 
 
 
303 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4132  LysR family transcriptional regulator  62.94 
 
 
303 aa  346  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.977393  normal  0.0579117 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4749  LysR family transcriptional regulator  62.24 
 
 
303 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0228204 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3618  LysR family transcriptional regulator  62.24 
 
 
303 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5534  LysR family transcriptional regulator  61.25 
 
 
306 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162022  normal  0.470463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40910  LysR family transcriptional regulatory protein  60.14 
 
 
301 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3471  LysR family transcriptional regulator  59.31 
 
 
305 aa  315  5e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0767  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  52.05 
 
 
306 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  44.67 
 
 
292 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2778  transcriptional regulator, LysR family  43.2 
 
 
302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23055  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  38.01 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  38.01 
 
 
301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 
301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 
301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  38.01 
 
 
301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  38.01 
 
 
301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  38.01 
 
 
301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  38.01 
 
 
299 aa  211  9e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  38.01 
 
 
299 aa  211  9e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
302 aa  210  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
298 aa  210  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
305 aa  210  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
303 aa  209  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 
323 aa  209  5e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  43.01 
 
 
289 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  43.68 
 
 
295 aa  206  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 
296 aa  202  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
297 aa  199  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  41.4 
 
 
302 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2752  transcriptional regulator, LysR family  39.43 
 
 
298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000767643 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  41.32 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3561  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
297 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  37.46 
 
 
301 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2740  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
297 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  38.59 
 
 
309 aa  193  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3179  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 
299 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2537  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 
299 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2154  transcriptional regulator, LysR family  40.21 
 
 
295 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 
305 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2671  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 
299 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0656105  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  41.83 
 
 
295 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 
296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2107  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 
295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329852  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5151  LysR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
302 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.58822 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 
299 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0833  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 
304 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 
328 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 
328 aa  188  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 
308 aa  188  9e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0421  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.14 
 
 
296 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3509  LysR family transcriptional regulator  44.49 
 
 
319 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.633276 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2326  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 
306 aa  187  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2466  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 
304 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708031  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5111  transcriptional regulator, LysR family  38.14 
 
 
297 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
298 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  39.3 
 
 
308 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
316 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 
297 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
299 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  41.99 
 
 
301 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5792  LysR family transcriptional regulator  41.28 
 
 
304 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
299 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  42.49 
 
 
300 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 
294 aa  185  8e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0544  transcriptional regulator, LysR family  41.67 
 
 
295 aa  185  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  41.13 
 
 
295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  40.99 
 
 
318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5674  transcriptional regulator, LysR family  39.72 
 
 
294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  40.86 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6115  transcriptional regulator, LysR family  39.37 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2682  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3623  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3663  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
296 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.148857  normal  0.207098 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3724  LysR family transcriptional regulator  38.74 
 
 
300 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4070  LysR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
297 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.409277  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 
306 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0395  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 
299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  40.75 
 
 
295 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1491  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 
308 aa  182  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00327558 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  35.42 
 
 
301 aa  182  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
300 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0640  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 
296 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0607  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 
296 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.693427  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2327  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
296 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0350  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 
295 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334528  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5585  LysR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
298 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0157  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 
296 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
300 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  41.29 
 
 
300 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2994  LysR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
295 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0317639  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2378  LysR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
305 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
293 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2510  LysR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
305 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0855  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
308 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.931414  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0486  transcriptional regulator CatR  40.07 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0038  transcriptional regulator, LysR family  38.52 
 
 
300 aa  179  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.744574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>