More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B2752 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B2752  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 
298 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000767643 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  91.84 
 
 
297 aa  558  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  47.77 
 
 
292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  49.14 
 
 
295 aa  257  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
298 aa  253  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 
323 aa  239  5.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  40.55 
 
 
301 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 
301 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
305 aa  226  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 
302 aa  223  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  39.31 
 
 
299 aa  222  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  39.31 
 
 
299 aa  222  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  39.31 
 
 
301 aa  221  8e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 
301 aa  221  8e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 
301 aa  221  8e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  39.31 
 
 
301 aa  221  8e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  39.31 
 
 
301 aa  221  8e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  39.31 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  39.31 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
305 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 
298 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  41.32 
 
 
318 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
296 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
316 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2411  transcription regulator protein  38.41 
 
 
311 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  38.25 
 
 
296 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
299 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
299 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2215  transcriptional regulator, LysR family  38.36 
 
 
314 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0544  transcriptional regulator, LysR family  37.67 
 
 
295 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  38.85 
 
 
296 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
299 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0421  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.89 
 
 
296 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2265  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
292 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  36.67 
 
 
306 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2155  LysR family substrate binding transcriptional regulator  38.28 
 
 
292 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.971753  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  38.85 
 
 
296 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  37.72 
 
 
308 aa  206  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
300 aa  205  6e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 
298 aa  205  8e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5111  transcriptional regulator, LysR family  38.33 
 
 
297 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  40.15 
 
 
304 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  40.15 
 
 
304 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  39.37 
 
 
293 aa  203  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
296 aa  202  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 
296 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0828  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  36.67 
 
 
320 aa  202  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.767447  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0395  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 
299 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  39.03 
 
 
295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2675  transcriptional regulator, LysR family  38.36 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1181  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  37.54 
 
 
331 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5792  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 
304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  37.06 
 
 
297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.112257 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.06 
 
 
297 aa  199  7e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  37.06 
 
 
297 aa  199  7e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
297 aa  199  7e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3404  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 
293 aa  199  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.729223  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
297 aa  199  7e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  37.06 
 
 
297 aa  198  7e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  37.06 
 
 
297 aa  199  7e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  39.43 
 
 
302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 
297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2134  transcriptional regulator, LysR family  39 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1021  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  36.81 
 
 
337 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127351  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2378  LysR family transcriptional regulator  37.12 
 
 
305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2510  LysR family transcriptional regulator  37.12 
 
 
305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0989  transcriptional regulator, LysR family  36.48 
 
 
321 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0678  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  37.33 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3363  hypothetical protein  36.93 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354704  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3370  hypothetical protein  36.93 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.04 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2333  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  37.33 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0128681  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3633  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1646  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  37.33 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.636647  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3465  hypothetical protein  36.93 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4628  transcriptional regulator, LysR family  37.11 
 
 
292 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0890971  normal  0.246233 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2953  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  37.33 
 
 
329 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0041469  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1028  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  37.25 
 
 
331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 
328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 
328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2466  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 
304 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708031  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3750  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 
297 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  35.17 
 
 
306 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05669  transcription regulator protein  35.17 
 
 
306 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
296 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1388  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
310 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0445  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 
295 aa  193  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1250  transcriptional regulator, LysR family  41.35 
 
 
311 aa  193  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0513927 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2119  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  37.93 
 
 
292 aa  193  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0037  transcriptional regulator, LysR family  36.96 
 
 
300 aa  193  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.279269  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0038  transcriptional regulator, LysR family  36.96 
 
 
300 aa  193  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.744574 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  40.31 
 
 
302 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 
301 aa  192  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08550  Transcriptional regulator, LysR family  36 
 
 
307 aa  192  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.763554  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  36.82 
 
 
302 aa  192  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0833  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 
304 aa  192  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2053  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
323 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.79519  normal  0.0937075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>