More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2320 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 305 aa  624  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  92.33 
 
 		 301 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  92.67 
 
 		 301 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  92.67 
 
 		 301 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  92.67 
 
 		 301 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  92.67 
 
 		 301 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  92.67 
 
 		 301 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  92.67 
 
 		 301 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  92.64 
 
 		 299 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  92.64 
 
 		 299 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  92.28 
 
 		 302 aa  568  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  47.24 
 
 		 292 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 295 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  44.95 
 
 		 298 aa  269  5e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  45.64 
 
 		 308 aa  256  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 323 aa  249  5e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  44.37 
 
 		 301 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 301 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 298 aa  239  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  43.01 
 
 		 296 aa  238  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  43.01 
 
 		 296 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5111  transcriptional regulator, LysR family  44.91 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0421  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  44.91 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0395  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2155  LysR family substrate binding transcriptional regulator  40.77 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.971753  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2265  LysR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 297 aa  228  9e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.86 
 
 		 300 aa  226  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2752  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000767643 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 289 aa  225  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 296 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 		 305 aa  222  7e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 301 aa  219  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 297 aa  219  5e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2043  transcriptional regulator, LysR family  45.2 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  40.48 
 
 		 295 aa  216  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2119  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  40.42 
 
 		 292 aa  215  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  42.47 
 
 		 304 aa  215  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  39.79 
 
 		 302 aa  215  7e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  39.25 
 
 		 306 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05669  transcription regulator protein  39.25 
 
 		 306 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0380  transcriptional regulator LysR family  40.07 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2740  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2344  transcriptional regulator, LysR family  44.8 
 
 		 298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 296 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  42.91 
 
 		 295 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  36.1 
 
 		 306 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3750  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 297 aa  212  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2134  transcriptional regulator, LysR family  38.54 
 
 		 304 aa  212  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5585  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 298 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3363  hypothetical protein  37.63 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354704  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1346  LysR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.638115  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3465  hypothetical protein  37.63 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3370  hypothetical protein  37.63 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 303 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 303 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 304 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 302 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 306 aa  209  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  38.65 
 
 		 304 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49340  LysR family transcriptional regulator protein  39.06 
 
 		 312 aa  209  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3633  LysR family transcriptional regulator  39.94 
 
 		 328 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 316 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2554  transcriptional regulator, LysR family  42.32 
 
 		 309 aa  208  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0664958  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0989  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 321 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1181  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  38.13 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5792  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 304 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.65 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  39.04 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1897  transcriptional regulator, LysR family  38.8 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1400  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1021  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  37.38 
 
 		 337 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1969  transcriptional regulator, LysR family  38.72 
 
 		 308 aa  205  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2332  transcriptional regulator, LysR family  38.72 
 
 		 308 aa  205  6e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.194223  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2058  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 299 aa  205  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90545  hitchhiker  0.00248149 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  39.16 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  39.64 
 
 		 297 aa  205  9e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3895  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 292 aa  205  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958573  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  39.16 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3948  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 291 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2282  LysR family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0266423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>