More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1400 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1400  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  98.68 
 
 		 303 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  98.68 
 
 		 303 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  67.23 
 
 		 295 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1346  LysR family transcriptional regulator  65.98 
 
 		 294 aa  350  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.638115  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1296  transcriptional regulator, LysR family  46.69 
 
 		 312 aa  228  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.502339  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  42.86 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1408  LysR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 323 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1392  LysR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0389535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1374  LysR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0834  LysR, substrate-binding  46.58 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 299 aa  216  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 299 aa  216  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  39.74 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  39.74 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  39.74 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  39.4 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  39.4 
 
 		 302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  39.4 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 305 aa  210  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 295 aa  203  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1356  LysR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal  0.0413241 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 296 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7097  transcriptional regulator, LysR family  42.66 
 
 		 296 aa  202  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.785925  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6486  LysR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  45.39 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  46.78 
 
 		 296 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1027  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174873 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 323 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  41.99 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4157  LysR substrate-binding protein  44.52 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0553  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 		 293 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  41.38 
 
 		 306 aa  192  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0175  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 302 aa  192  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602241  normal  0.0372511 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  46.44 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  46.59 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1775  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310759  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  40.48 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7143  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 		 295 aa  185  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.297032  normal  0.653171 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4202  LysR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  40.28 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2554  transcriptional regulator, LysR family  45.83 
 
 		 309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0664958  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4305  LysR family transcriptional regulator  45.66 
 
 		 294 aa  182  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.201551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6203  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4587  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.781824  normal  0.831534 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4453  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.47384 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 289 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3962  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195836  normal  0.175267 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4425  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6393  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  39.66 
 
 		 302 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 299 aa  179  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4537  LysR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 302 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309073  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3612  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 296 aa  179  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.395284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5884  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 296 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.279758 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3831  LysR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 302 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5520  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 296 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579894  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2500  transcriptional regulator, LysR family  41.69 
 
 		 297 aa  178  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3013  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 293 aa  178  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0445  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0066  transcriptional regulator, LysR family  41.16 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 301 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0639  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1308  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4207  LysR substrate-binding protein  37.59 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4123  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.454072 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2332  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.194223  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1969  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 303 aa  176  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 299 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2282  LysR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 302 aa  175  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0266423 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 296 aa  175  7e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05372  transcription regulator protein  38.7 
 
 		 335 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  39.01 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  40.66 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5843  LysR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271378 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3722  LysR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2704  LysR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.995424  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4970  transcriptional regulator, LysR family  39.18 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126085  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2344  transcriptional regulator, LysR family  38.97 
 
 		 298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  42.26 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>