More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1346 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1346  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  564  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.638115  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  66.32 
 
 		 303 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  66.32 
 
 		 303 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1400  LysR family transcriptional regulator  65.75 
 
 		 303 aa  358  9e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  61.3 
 
 		 295 aa  339  4e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  40.57 
 
 		 301 aa  220  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  40.57 
 
 		 301 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  40.57 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  40.57 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  40.89 
 
 		 292 aa  218  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  40.21 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  40.21 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  40.21 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 298 aa  215  8e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0834  LysR, substrate-binding  45.21 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1374  LysR family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1296  transcriptional regulator, LysR family  45.05 
 
 		 312 aa  210  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.502339  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1392  LysR family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 306 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0389535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1408  LysR family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 323 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  48.23 
 
 		 296 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 296 aa  208  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  47.52 
 
 		 296 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3612  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.395284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  42.61 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7097  transcriptional regulator, LysR family  42.86 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.785925  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1027  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 299 aa  195  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0553  transcriptional regulator, LysR family  43.68 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1775  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 296 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310759  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  41.55 
 
 		 294 aa  195  9e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 296 aa  195  9e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 301 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  42.86 
 
 		 302 aa  193  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7143  transcriptional regulator, LysR family  40.89 
 
 		 295 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.297032  normal  0.653171 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08550  Transcriptional regulator, LysR family  39.72 
 
 		 307 aa  192  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.763554  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4305  LysR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 294 aa  192  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.201551 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0639  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 296 aa  191  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0184  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4453  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.47384 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4587  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.781824  normal  0.831534 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0395  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 299 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 301 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1969  transcriptional regulator, LysR family  40.94 
 
 		 308 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2332  transcriptional regulator, LysR family  40.94 
 
 		 308 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.194223  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  41.03 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  41.64 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6486  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  42.76 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1356  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 329 aa  186  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal  0.0413241 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 297 aa  185  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 319 aa  185  8e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 299 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  39.24 
 
 		 302 aa  185  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5843  LysR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271378 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.08 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3013  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 293 aa  182  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3084  transcriptional regulator, LysR family  43.56 
 
 		 296 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0544  transcriptional regulator, LysR family  44.07 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05372  transcription regulator protein  39.8 
 
 		 335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4207  LysR substrate-binding protein  36.11 
 
 		 297 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0421  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.08 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  42.52 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 307 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2932  DNA-binding transcriptional activator XapR  37.28 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000456471  normal  0.0988351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6203  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5149  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 300 aa  179  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4157  LysR substrate-binding protein  42.03 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1156  LysR family transcriptional regulator  45.25 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4970  transcriptional regulator, LysR family  38.89 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126085  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2678  DNA-binding transcriptional activator XapR  37.76 
 
 		 294 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0441451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2654  DNA-binding transcriptional activator XapR  37.76 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00016667  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5111  transcriptional regulator, LysR family  40.4 
 
 		 297 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2784  DNA-binding transcriptional activator XapR  37.76 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00240936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0066  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 303 aa  176  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2612  DNA-binding transcriptional activator XapR  37.41 
 
 		 294 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0177144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3285  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 301 aa  175  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2279  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 299 aa  175  7e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1134  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 294 aa  175  7e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>