More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1888 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  583  1.0000000000000001e-165  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  42.41 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 293 aa  226  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 305 aa  219  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  41.18 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  41.18 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  40.83 
 
 		 301 aa  212  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 301 aa  212  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 301 aa  212  7e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  40.83 
 
 		 301 aa  212  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  40.83 
 
 		 301 aa  212  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  40.83 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  40.83 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 295 aa  208  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  47.49 
 
 		 296 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  47.49 
 
 		 296 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3793  LysR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 304 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  44.14 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  45.73 
 
 		 308 aa  202  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 296 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5792  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316053 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2461  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1850  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 316 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2466  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 304 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.708031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0421  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  43.25 
 
 		 296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3750  LysR family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5111  transcriptional regulator, LysR family  42.91 
 
 		 297 aa  195  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 318 aa  195  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0395  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 299 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 296 aa  195  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0833  LysR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 304 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  42.27 
 
 		 298 aa  195  9e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  41.91 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 299 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 299 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2220  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 317 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0553  transcriptional regulator, LysR family  39.86 
 
 		 293 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1181  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  41.78 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  39.32 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2510  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 305 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 295 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  43.15 
 
 		 295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4970  transcriptional regulator, LysR family  42.49 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126085  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0544  transcriptional regulator, LysR family  46.4 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2378  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 307 aa  188  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 300 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1021  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  40.97 
 
 		 337 aa  188  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.127351  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  39.71 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  37.33 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1346  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.638115  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.67 
 
 		 300 aa  187  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 300 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0678  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  42.37 
 
 		 315 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1646  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  42.37 
 
 		 315 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.636647  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2333  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  42.37 
 
 		 315 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0128681  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1538  LysR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 300 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.337495  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1756  LysR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 300 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.497412  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2782  LysR family regulatory protein  39.51 
 
 		 300 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.105762  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2265  LysR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 300 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503277  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1028  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  40.39 
 
 		 331 aa  185  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3053  LysR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 300 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2043  transcriptional regulator, LysR family  40.98 
 
 		 298 aa  185  7e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0834  LysR, substrate-binding  41.82 
 
 		 330 aa  185  7e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 300 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1388  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 310 aa  185  8e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.813724 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2953  isoleucine biosynthesis transcriptional activator IlvR  42.37 
 
 		 329 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0041469  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  38.06 
 
 		 301 aa  185  9e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2752  transcriptional regulator, LysR family  34.48 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000767643 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2649  transcriptional regulator  39.16 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 296 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  37.06 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2704  LysR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.995424  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0855  LysR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.931414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0828  isoleucine biosynthesis transcriptional activator  42.57 
 
 		 320 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.767447  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1400  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 303 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>