More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5293 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5293  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382002 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0620  LysR, substrate-binding  58.5 
 
 		 307 aa  298  7e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3308  transcriptional regulator, LysR family  51.06 
 
 		 299 aa  238  6.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1427  LysR family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3861  LysR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378583  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3737  LysR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 292 aa  225  7e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.440992 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0276  transcriptional regulator, LysR family  45.16 
 
 		 295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265614 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3577  transcriptional regulator, LysR family  46.48 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0937432  normal  0.112769 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4879  transcriptional regulator, LysR family  41.34 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3380  transcriptional regulator, LysR family  40.74 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1618  LysR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18090  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.502124  normal  0.864979 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3378  transcriptional regulator, LysR family  37.12 
 
 		 306 aa  143  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587515  normal  0.118229 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 301 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  37.25 
 
 		 343 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3362  LysR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 301 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0184586  normal  0.124308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3027  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 296 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  0.0983391 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2830  LysR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5025  transcriptional regulator, LysR family  37.45 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.860643  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3012  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3058  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  34.41 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4229  putative LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.552994  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1670  LysR substrate-binding protein  38.6 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.903503  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 303 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1478  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0854082  hitchhiker  0.000187974 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0390  transcriptional regulator, LysR family  39.09 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  34.98 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  35.69 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0328  LysR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280372 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  32.38 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3051  transcriptional regulator, LysR family  38.52 
 
 		 285 aa  129  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32995  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5650  transcriptional regulator, LysR family  32.51 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  30.28 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0395  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3167  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 307 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0719  LysR family regulatory protein  33.45 
 
 		 322 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0714085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2879  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 307 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0137  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 307 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.750096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1451  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 307 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870434  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0532  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 307 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.693788  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0550  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 307 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  36.13 
 
 		 294 aa  125  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1650  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 301 aa  125  9e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  35.23 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2077  transcriptional regulator, LysR family  38.46 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1045  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0699  LysR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2077  LysR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1196  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 293 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254346  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  38.55 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05669  transcription regulator protein  38.55 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3153  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00364917  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 304 aa  122  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 297 aa  122  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2752  transcriptional regulator, LysR family  27.97 
 
 		 298 aa  122  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000767643 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2323  oxidative stress transcriptional regulator  32.38 
 
 		 301 aa  122  9e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 320 aa  122  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5111  transcriptional regulator, LysR family  39.36 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 295 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1026  LysR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0443  transcriptional regulator, LysR family  31.94 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  35.04 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  32.28 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4609  transcriptional regulator, LysR family  34.08 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.461419 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0421  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.77 
 
 		 296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2554  transcriptional regulator, LysR family  39.43 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0664958  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3775  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0352  transcriptional regulator, LysR family  38.84 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3323  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0711414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3562  LysR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4591  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  36.77 
 
 		 308 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  29.11 
 
 		 300 aa  119  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3435  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0821  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0342019  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 293 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51620  LysR family transcriptional regulator protein  33.89 
 
 		 301 aa  119  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3514  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 295 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0347689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3211  transcriptional regulator, LysR family  28.91 
 
 		 290 aa  118  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0334  transcriptional regulator, LysR family  35.48 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.937617  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1888  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0844  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.033432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0175  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602241  normal  0.0372511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>