More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0334 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0334  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 323 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.937617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0323  transcriptional regulator, LysR family  99.69 
 
 		 323 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.712215  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0312  LysR family transcriptional regulator  95.05 
 
 		 323 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2149  LysR family transcriptional regulator  76.3 
 
 		 307 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0529153 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  42.81 
 
 		 296 aa  229  4e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0334  LysR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 320 aa  229  7e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  42.45 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4222  LysR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79182  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0187  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.99 
 
 		 302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0127  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  44.33 
 
 		 305 aa  226  6e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.985261  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0193  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.99 
 
 		 302 aa  225  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4530  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  42.86 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  hitchhiker  0.00000332798 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4456  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  42.86 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210908 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4453  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  42.86 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.730139  hitchhiker  0.0000741656 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4366  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  42.86 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4335  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  42.86 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.916411 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03846  DNA-binding transcriptional dual regulator  43.49 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.782076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4025  transcriptional regulator, LysR family  43.49 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03795  hypothetical protein  43.49 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4448  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.49 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4409  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.49 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.386018  normal  0.0576457 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4055  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.49 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4195  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.49 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5423  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.49 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.748146 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4503  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.49 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.030834  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2714  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  42.32 
 
 		 302 aa  223  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4025  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.34 
 
 		 305 aa  222  8e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2425  LysR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.540189  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0119  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.64 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.985596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0138  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.64 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3788  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.64 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4079  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  43.64 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2886  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 301 aa  220  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03200  transcriptional regulator  44.11 
 
 		 300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002320  Transcriptional regulator, LysR family  41.14 
 
 		 303 aa  219  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.726256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4775  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  42.96 
 
 		 305 aa  219  7e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760624  hitchhiker  0.00336049 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0036  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  40.85 
 
 		 304 aa  216  5e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00035  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  40.73 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0783  LysR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 311 aa  215  7e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33611  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0871  oxidative stress transcriptional regulator  45.39 
 
 		 311 aa  215  7e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000180312  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2782  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 301 aa  215  9e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427064  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2323  oxidative stress transcriptional regulator  44.15 
 
 		 301 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0001  LysR substrate binding domain protein  39.93 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000100891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0434  transcriptional regulator, LysR family  42.46 
 
 		 312 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351851  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2213  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  40.55 
 
 		 297 aa  210  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0382  LysR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 317 aa  208  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1654  hydrogen peroxide-inducible genes activator  40.41 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00724333  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5771  transcriptional regulator LysR family  40.79 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0520  hydrogen peroxide-inducible genes activator  40.41 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.454545  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0631  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.808562  normal  0.903361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5250  transcriptional regulator, LysR family  46.13 
 
 		 313 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3588  LysR family transcriptional regulator  43.34 
 
 		 299 aa  205  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0653  LysR family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105703  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2432  LysR family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 320 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0362  LysR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3497  transcriptional regulator, substrate-binding, LysR family protein  37.71 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.794623  hitchhiker  0.0000380526 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04591  oxidative stress transcriptional regulator  44.71 
 
 		 313 aa  202  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1375  LysR family transcriptional regulator  41.47 
 
 		 311 aa  202  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58375  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0687  transcriptional regulator, LysR family  44.71 
 
 		 320 aa  202  8e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.366193 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1585  LysR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3406  transcriptional regulator, LysR family  44.48 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0029  regulatory protein, LysR  40.67 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.242113 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4725  transcriptional regulator, LysR family  41.94 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2792  LysR family transcriptional regulator  42.43 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1346  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.124004  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1336  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0531475  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4718  hydrogen peroxide-inducible genes activator  37.54 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3535  transcriptional regulator, LysR family  43.45 
 
 		 323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300958  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4681  transcriptional regulator, LysR family  42.62 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.468795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6388  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3286  LysR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.254644  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3739  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.717698  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3211  LysR substrate-binding  43.13 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.847319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4881  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.635282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2864  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0036  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0724  LysR family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 327 aa  196  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3053  LysR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 309 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.979958  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2291  LysR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11333  normal  0.519031 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0354  transcriptional regulator OxyR  39.66 
 
 		 317 aa  193  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.241733  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1816  transcriptional regulator, LysR family  43.99 
 
 		 304 aa  193  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2140  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 303 aa  192  5e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.828195  normal  0.0106328 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0321  transcriptional regulator OxyR  39.66 
 
 		 325 aa  192  7e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2381  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 308 aa  192  9e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128975  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2805  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 316 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3802  LysR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.238076  normal  0.337014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0224  LysR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 312 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1241  transcriptional regulator, LysR family  41.29 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2941  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 318 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4389  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 301 aa  188  8e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2661  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 319 aa  189  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.230449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2322  LysR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 298 aa  188  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1281  oxidative stress regulatory protein OxyR  37.85 
 
 		 319 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4242  transcriptional regulator, LysR family  42.76 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0020  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1157  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 326 aa  188  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1919  LysR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.156623  normal  0.456297 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0472  LysR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48440  Transcriptional regulator, LysR family protein  38.31 
 
 		 311 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0556278  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0709  transcriptional regulator OxyR, putative  41.73 
 
 		 301 aa  187  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>